山西省科技攻关计划项目(20080311016)
- 作品数:1 被引量:55H指数:1
- 相关作者:王原媛李平白云凤冯瑞云张维锋更多>>
- 相关机构:山西省农业科学院山西大学山西农业大学更多>>
- 发文基金:山西省科技攻关计划项目山西省回国留学人员科研经费资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- RNA干扰在植物抗病毒转基因研究中的应用
- 植物病毒病是农业生产上的一种重要病害,严重影响农作物的产量和品质。迄今尚无有效药剂防治植物病毒病。真核细胞中出现的双链RNA会被核酸酶切割成小干扰RNA,诱导与之同源的RNA降解。把源自病毒的基因构建成反向重复结构转入植...
- 白云凤冯瑞云张维锋
- 文献传递
- 籽粒苋苹果酸酶(NAD-ME)基因密码子偏好性分析被引量:55
- 2011年
- 遗传密码子是生命信息的基本遗传单位,每种氨基酸对应1~6个同义密码子.特定物种在长期进化中形成了适应自身基因组环境的密码子使用偏性.运用CHIPS、CUSP和CodonW程序分析自主克隆的籽粒苋NAD-ME基因的密码子偏好性,并与马铃薯等7种植物的ME基因密码子偏好性进行比较,以期为该基因在作物遗传改良中选择合适的受体植物提供依据.结果表明,籽粒苋NAD-ME基因偏好于以A或T结尾的密码子,其它几种被比较作物的ME基因也有同样的趋势,但双子叶植物的偏好性更强.基于NAD-ME基因的密码子使用偏性的系统聚类分析表明,籽粒苋与马铃薯、拟南芥、葡萄、蓖麻、毛果杨等双子叶植物聚为1类,玉米和高粱这2个单子叶植物聚为1类,预示籽粒苋NAD-ME基因更适合导入马铃薯等双子叶植物.对籽粒苋NAD-ME基因的密码子偏好性与大肠杆菌和酵母的基因组密码子偏好性进行比较,发现均存在差异,与大肠杆菌的差异高于酵母,表明酵母表达系统要优于大肠杆菌表达系统.若要进一步提高籽粒苋NAD-ME基因在大肠杆菌或酵母中的表达水平,尚需对其密码子进行优化.
- 李平白云凤冯瑞云王原媛张维锋
- 关键词:籽粒苋密码子偏好性聚类分析