中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610032012030)
- 作品数:5 被引量:15H指数:3
- 相关作者:熊和平陈平王延周陈继康喻春明更多>>
- 相关机构:中国农业科学院麻类研究所更多>>
- 发文基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 一种适用于PCR检测的苎麻陈年原麻DNA提取方法被引量:4
- 2012年
- 本研究以常温干燥保存一年和六年的陈年苎麻原麻为材料,采用改进的CTAB法,对苎麻原麻DNA进行了提取。琼脂糖凝胶电泳结果表明,得到的DNA大小在20kb以上,2010年原麻提取DNA的条带明显比2005年原麻的清晰;PCR扩增实验证明用此方法提取的DNA可直接用于PCR检测。
- 陈平谭龙涛喻春明王延周陈继康熊和平
- 关键词:苎麻DNA提取
- 苎麻与大麻CesA1基因的生物信息学分析被引量:4
- 2013年
- 本文利用生物信息学方法从转录组测序数据库中分离了苎麻纤维素合成酶CesA1(BnCesA1)基因全长编码区序列(NCBI登录号:KC112993),并与大麻纤维素合成酶(CsCesA1)进行了氨基酸组成成分、理化性质以及二级结构比较,构建了CesA1基因家族的进化树。结果显示BnCesA1由3249个碱基组成,编码1082个氨基酸组成的蛋白,CsCesA1由3198个碱基组成,编码1065个氨基酸组成的蛋白。它们是疏水性脂溶蛋白,都含有6个跨膜区,二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主,存在小部分β-转角或扩展链。两基因的核酸序列同源性为86%,氨基酸序列同源性为93%。本文结果为麻类作物纤维素合成酶基因的进一步功能分析提供了基础。
- 陈平喻春明王延周陈继康熊和平
- 关键词:纤维素合成酶苎麻大麻生物信息学分析
- 苎麻cpSSR标记筛选及在亲缘关系研究中的应用被引量:2
- 2014年
- 利用cp SSR引物(叶绿体微卫星)分子标记对苎麻[(Boehmeria nivea(L.)Gaudich.]属植物进行亲缘关系分析。从22对cp SSR引物中,筛选出5对在苎麻中扩增良好、条带清晰、重复性好的引物,多态性比例为22.73%。5对引物在8份供试材料中共扩增出16条多态条带,平均每对引物的多态性条带为3.2条。聚类分析将这些材料分为3类,分类结果与采用叶绿体基因序列分类结果一致。
- 陈平喻春明王延周陈继康卢凌霄熊和平
- 关键词:亲缘关系CPSSR
- 苎麻叶绿体DNA的提取及分析被引量:5
- 2013年
- 以成熟中苎1号叶片为材料,采用Percoll密度梯度离心法,分离获得完整的叶绿体,并用植物基因组DNA提取试剂盒提取叶绿体DNA,经核酸和蛋白分析仪、琼脂糖电泳、核基因组及叶绿体基因组特异引物PCR检测,结果表明:所提取的苎麻叶绿体DNA纯度高,不含核基因组DNA,并适用于基因扩增等分子操作,为深入研究苎麻叶绿体基因组奠定基础。同时,本方法操作简便、快速,适用性广,为其它物种叶绿体DNA的提取提供借鉴。
- 郑建树喻春明陈平王延周谭龙涛卢凌霄陈继康朱涛涛熊和平
- 关键词:苎麻叶绿体DNA
- 苎麻胞液型谷氨酰胺合成酶基因的克隆和超量表达载体构建
- 2014年
- 谷氨酰胺合成酶是植物氮代谢途径中的关键酶,分为胞液型(GS1)和质体型(GS2)两种。本文首次从苎麻中克隆了一个胞液型谷氨酰胺合成酶基因BnGS1-1,并利用生物信息学对其序列和结构特征进行了分析。该基因序列全长1205 bp,含有一个1071 bp的ORF区,编码356个氨基酸残基的多肽,pI和Mw分别为5.64和39.19 KDa,具有beta-Grasp和catalytic两个保守功能域;蛋白序列在56、92、249和297位点分别为Asp、Cys、His和Glu。系统进化分析表明BnGS1-1与大豆(Glycine max)、四季豆(Phaseolus vulgaris)、苜蓿(Medicago sativa)、棉花(Gossypium raimondii)在同一个分支上。同时,将BnGS1-1与pBI121载体利用同源重组技术,成功构建了植物超量表达载体。因此,本研究为了解和改善苎麻饲用特性提供了物质和理论基础。
- 郑建树喻春明陈平王延周谭龙涛朱涛涛陈继康卢凌霄熊和平
- 关键词:苎麻GS1基因克隆