国家教育部博士点基金(20113603110001)
- 作品数：3 被引量：22H指数：2
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- 相关领域：农业科学更多>>
- 南方水稻黑条矮缩病毒江西分离物CP基因克隆及序列分析
- 2013年
- 根据GenBank已登陆的SRBSDV S10核苷酸序列设计引物,克隆SRBSDV江西分离物外壳蛋白(CP)基因,结合已公布的序列,通过生物信息学方法进行序列分析。结果表明,SRBSDV江西分离物CP基因全长1 674个核苷酸,推测编码557个氨基酸,与已报道的SRBSDV CP基因之间核苷酸同源性为97.5%～100%,氨基酸同源性为97.7%～100%。SRBSDV CP基因核苷酸序列高度保守,保守位点占全部位点的83.5%。没有发现重组事件。本研究首次报道根据系统发育进化树,SRBSDV可分为2大组群,不存在明显的地域和寄主分化。
- 孙晓棠崔汝强欧阳林娟胡丽芳傅军如贺晓鹏边建民贺浩华朱昌兰
- 关键词：南方水稻黑条矮缩病毒CP基因基因克隆
- 水稻纹枯病抗性关联分析及抗性等位变异发掘被引量：18
- 2014年
- 采用苗期微室接种鉴定法,用144个分布于水稻全基因组的多态性标记,利用TASSEL软件GLM(Q)、MLM(Q+K)和MLM(PCA+K)3种模型对456份水稻材料组成的自然群体进行纹枯病抗性关联分析。结果发现,有13个标记位点至少在2种模型中均被检测到与纹枯病抗性显著关联,单个位点可解释表型变异的1.84%～8.42%;其中10个标记位点位于以往报道的连锁定位的抗纹枯病QTL附近,3个标记位点(RM1036、RM5371和RM7585)是未曾报道的新的抗病相关位点。抗性等位变异RM7585-150对纹枯病发病病级减效效应最大;有259份材料携带抗性等位变异RM5371-129,占供试材料总数的56.8%,只有26份材料携带抗性等位变异RM1036-82,占供试材料总数的5.7%。水稻纹枯病发病病级与其含有的抗性等位变异数量呈极显著的负相关。本研究结果将为水稻抗纹枯病分子标记辅助育种提供理论依据。
- 孙晓棠卢冬冬欧阳林娟胡丽芳边建民彭小松陈小荣傅军如贺晓鹏贺浩华朱昌兰
- 关键词：水稻纹枯病
- 双重RT-PCR法同时快速检测南方水稻黑条矮缩病毒和水稻黑条矮缩病毒被引量：4
- 2012年
- 南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)和水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)在病害症状、传播介体及寄主等方面非常相似,田间很难对其进行诊断及鉴定。根据SRBSDV与RBSDV外壳蛋白(CP)基因核苷酸序列差异设计特异性引物,建立一种快速、准确的双重PT-PCR鉴别方法,为SRBSDV和RBSDV的流行监测提供技术支持。
- 孙晓棠崔汝强贺浩华欧阳林娟胡丽芳彭小松陈小荣朱昌兰
- 关键词：水稻黑条矮缩病毒外壳蛋白基因特异性检测
