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广东省科技攻关计划(A2004378)
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SARS冠状病毒S2基因变异性分析
2006年
目的测定SARS冠状病毒GD322株S2基因序列并对SARS-CoV S2基因进行系统进化树分析。方法用RT-PCR 法从SARS-CoV GD322株基因组中扩增S2基因片段并克隆至pGEM-T载体,转化大肠杆菌DH5α株后测序。利用 Lasergene、ClustalX、DNAman和Treeview等软件,将基因序列翻译成氨基酸序列后,与早、中、晚期各地暴发的SARS-CoV S2蛋白序列进行比对,构建系统进化树,并在Internet网数据库中对S2蛋白氨基酸序列进行T细胞抗原表位预测。结果随着SARS-CoV的传播流行,S2基因趋于稳定,晚期的SARS-CoV S2基因的同源性达到99.9%。T细胞抗原表位预测发现,SARS-CoV S2蛋白第57位氨基酸突变对T细胞抗原表位有影响。结论 SARS流行过程中SARS-CoV S2 基因较为稳定,S2蛋白57位氨基酸的突变可影响病毒T细胞抗原表位。
周浩
龙北国
张文炳
江丽芳
陈丽丹
贡树基
赵卫
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SARS-COV
S2基因
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