中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项项目(1630022011024)
- 作品数：14 被引量：52H指数：4
- 相关作者：曾日中黎瑜康桂娟邓治李德军更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院海南大学内蒙古农业大学更多>>
- 发文基金：中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项项目国家自然科学基金海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 泛素结合酶RAD6的结构与功能研究进展被引量：1
- 2013年
- 泛素复合体对蛋白的修饰可以改变蛋白定位、活性和稳定性。泛素结合酶E2在其中起关键作用。RAD6是典型的泛素结合酶,在泛素复合体组装、DNA损伤修复、调控基因表达和细胞周期等生理过程中具有重要作用。本文综述了RAD6蛋白的结构、与其互作的泛素蛋白连接酶E3及其功能研究进展,并展望其在作物研究中的应用。
- 覃碧邓治刘长仁李德军
- 关键词：泛素
- 巴西橡胶树伤害诱导蛋白基因的克隆及表达分析被引量：1
- 2012年
- 为了研究橡胶树在逆境胁迫下的分子机制,根据巴西橡胶树抑制消减(SSH)文库和NCBI数据库中的伤害诱导蛋白基因拼接序列设计嵌套引物,通过RACE技术获得基因的完整开放阅读框,命名为HbWUN1。序列分析表明HbWUN1长872bp,含有390bp的开放阅读框,编码129个氨基酸。生物信息学分析结果表明HbWUN1不含信号肽和跨膜结构,为亲水性蛋白。进化分析结果显示,橡胶树HbWUN1与拟南芥NP_974279.1聚成一类。RT-PCR分析结果表明HbWUN1表达无组织特异性,在胶乳中表达量最高。在叶片不同发育时期HbWUN1表达存在变化,在衰老期最高。此外,低温、伤害、高盐、乙烯和茉莉酸处理均调控HbWUN1表达,推测其可能在橡胶树逆境反应中发挥作用。
- 刘向红邓治李德军
- 关键词：橡胶树基因
- 巴西橡胶树HbNAC1基因启动子的克隆及序列分析被引量：3
- 2012年
- NAC转录因子是植物特有的一类转录调控因子,在植物的生长发育、激素调节和境胁迫应答中具有重要的功能。为研究NAC转录因子在巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)抗逆胁迫中的功能,本项目组根据巴西橡胶树NAC转录因子-HbNAC1基因序列,通过Genome Walking方法从巴西橡胶基因组DNA中获得了长度为1861bp的HbNAC1基因的5'调控区片段,序列分析表明该段序列含有一个典型的真核生物核心启动子区域,转录起始位点T位于起始密码子上游52bp处。该启动子序列除了含有TATA-box、CAAT-box等基本顺式作用元件外,还具有茉莉酸响应元件以及大量光顺式作用元件和逆境胁迫诱导相关的顺式调控元件,这表明HbNAC1基因在橡胶树逆境胁迫应答过程具有重要功能,其启动子可能是一个光诱导型和组织特异性启动子。
- 康桂娟黎瑜夏可灿聂智毅曾日中
- 关键词：巴西橡胶树顺式调控元件逆境胁迫
- 利用oligo芯片技术鉴定橡胶树死皮相关基因被引量：4
- 2012年
- 橡胶树死皮(Tapping Panel Dryness,TPD)是天然橡胶单产提高的主要限制因子之一,给橡胶种植业带来严重危害。本研究利用定制橡胶树oligo芯片,通过提取死皮和健康橡胶树胶乳总RNA,标记并反转录成cDNA后与橡胶树oligo芯片进行杂交鉴定TPD相关基因,利用RT-PCR技术对芯片结果进行验证。对芯片数据分析结果显示,以2倍标准在死皮与健康橡胶树间筛选到26个差异表达基因,其功能涉及橡胶生物合成、细胞程序性死亡、细胞抗性及防御反应、活性氧代谢、DNA甲基化、泛素-蛋白酶体、信号传导、蛋白质合成、加工及转运等调控途径。进一步的RT-PCR验证结果表明,随机选取12个基因的表达模式均与芯片结果一致。本研究为大规模鉴定TPD相关基因和揭示TPD发生分子机制奠定了基础。
- 覃碧刘向红邓治李德军
- 关键词：橡胶树死皮RT-PCR
- 巴西橡胶树HbNTL2基因的克隆和表达分析被引量：3
- 2015年
- 利用RT–PCR和实时荧光定量PCR技术,对巴西橡胶树膜结合转录因子Hb NTL2进行克隆和表达,并通过酵母试验进行转录激活功能分析。结果表明,Hb NTL2基因的开放阅读框为1 380 bp,编码一个由459个氨基酸组成的蛋白,该蛋白属于NAC转录因子家族中的ANAC001亚族;在第6~172位氨基酸之间含有典型的NAC结构域,第433~453位氨基酸具有跨膜结构域,是膜结合NAC转录因子;Hb NTL2具有转录激活功能,转录激活区在C–末端;Hb NTL2在叶片的表达高于在橡胶树的其他部位,受割胶、茉莉酸（JA）和乙烯（ET）处理以及低温胁迫诱导。综合分析结果表明,Hb NTL2可能参与调控巴西橡胶树的生长发育和胁迫应答过程。
- 康桂娟黎瑜曾日中
- 关键词：巴西橡胶树基因克隆基因表达转录激活活性
- 巴西橡胶树Profilin基因克隆及生物信息学分析被引量：2
- 2011年
- 为了研究橡胶树中Profilin蛋白的功能,利用橡胶树Profilin基因部分已知序列设计引物,采用3′-RACE技术获得Profilin基因完整开放阅读框,该基因编码131个氨基酸,含有一个保守的PROF结构域。在HbPro1蛋白中没有预测到跨膜区和信号肽,二级结构分析表明HbPro1属于混合型蛋白。对25个Profilin蛋白系统进化分析表明,HbPro1在进化上具有保守性,属植物类Profilin蛋白家族。HbPro1基因的克隆和生物信息学分析为深入研究其功能奠定了基础。
- 李德军刘向红邓治
- 关键词：巴西橡胶树基因克隆
- 巴西橡胶树HbNAC33基因的克隆和表达分析被引量：8
- 2014年
- 植物特有的NAC转录因子在植物的生长发育、胁迫应答和激素调节等方面具有重要功能。本研究从橡胶树胶乳cDNA中克隆了HbNAC33基因,生物信息学分析显示该基因的完整开放阅读框（ORF）为1 092 bp,编码363个氨基酸。HbNAC33蛋白的N-端第3～156位氨基酸之间含有一个典型的NAC结构域,酵母试验表明,HbNAC33具有转录激活活性,转录激活区在C-端,具备了NAC转录因子的基本特征。序列比对和系统进化分析表明HbNAC33蛋白属于NAC转录因子家族中的ANAC011亚族。实时荧光定量PCR分析表明,HbNAC33在叶中的表达量显著高于其他部位;割胶,乙烯利（ET）和茉莉酸（JA）处理均能诱导HbNAC33的表达上调。以上结果表明,HbNAC33可能参与植物的生长发育和胁迫应答过程。
- 康桂娟黎瑜曾日中
- 关键词：基因克隆转录激活活性
- 利用巴西橡胶树寡核苷酸芯片筛选死皮相关基因被引量：1
- 2012年
- 以健康和死皮巴西橡胶树品系热研7-33-97树皮为实验材料,利用定制橡胶树寡核苷酸芯片筛选橡胶树死皮相关基因。在橡胶树寡核苷酸芯片包含的566个基因中,死皮与健康树树皮差异表达倍数在2倍或2倍以上的有56个,占筛选转录本总数的9.9%。在56个死皮相关基因中,死皮树中上调表达基因有3个,下调表达基因有53个。这些死皮相关基因共涉及8个功能分类,"抗性及防御反应"所占比例最高,接下来是"蛋白质合成、加工及转运"和"代谢和能量",以上三类功能基因占66.07%。此外,死皮相关基因还涉及"细胞结构、生长及分化"、"细胞信号转导"、"转录相关"、"橡胶生物合成"和"未知功能"。为验证芯片结果的可信性,随机选取18个基因进行RT-PCR分析,结果表明被检测基因表达模式均与芯片结果完全一致。本研究鉴定并分析了死皮相关基因,为进一步揭示橡胶树死皮发生机制奠定了基础。
- 李德军覃碧邓治刘向红
- 关键词：巴西橡胶树寡核苷酸芯片
- 巴西橡胶树HbNTL1基因启动子的克隆与序列分析被引量：3
- 2013年
- 膜结合NAC转录因子(NTLs)是植物NAC转录因子家族中一类C端具有跨膜结构域(transmembrane motifs,TMs)的转录调控因子,在植物生长发育、激素调节和逆境胁迫应答中具有重要的功能。根据巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)膜结合类NAC转录因子HbNTL1基因cDNA序列,利用基因组步移的方法从巴西橡胶树叶片基因组DNA中克隆获得了HbNTL1基因上游1 718 bp的调控片段。序列分析表明,该段序列含有一个典型的真核生物核心启动子区域,转录起始位点A位于起始密码子上游206 bp处。该启动子序列除了含有多个TATA-box、CAAT-box等基本顺式作用元件外,还存在赤霉素、茉莉酸和脱落酸等激素响应元件以及大量逆境胁迫诱导相关的顺式调控元件,如ABRE、DOFCOREZM、MYBCORE、W-box和MYCCONSENSUSATHSE等反应元件,表明HbNTL1转录因子可能是一个逆境胁迫相关NAC转录因子,在橡胶树抵御逆境胁迫的生理过程中具有重要功能。
- 康桂娟黎瑜曾日中聂智毅
- 关键词：巴西橡胶树顺式调控元件逆境胁迫
- 巴西橡胶树膜结合NAC转录因子HbNTL1的克隆及生物信息学分析被引量：4
- 2012年
- 根据巴西橡胶树胶乳cDNA文库中筛选到的NAC EST序列,克隆了橡胶树膜结合NAC转录因子,HbNTL1的cDNA和基因组DNA序列。生物信息学分析显示HbNTL1基因包含6个外显子和5个内含子,开放阅读框(ORF)为1704bp,编码了567个氨基酸。HbNTL1编码蛋白的相对分子量为62.52kDa,理论等电点PI为4.62,N-端具有保守的NAC结构域,高度变异的C-端有一个跨膜结构域(TM)。序列比对和系统进化分析表明,HbNTL1蛋白属于NAC转录因子家族中的NAC2亚族,推测其可能与橡胶树生长发育和胁迫应答有关。
- 康桂娟曾日中聂智毅代龙军段翠芳黎瑜
- 关键词：巴西橡胶树基因克隆生物信息学分析
