国家自然科学基金(30600589) 作品数:6 被引量:14 H指数:2 相关作者: 任宁 武金才 王鲁 孙惠川 史炯 更多>> 相关机构: 复旦大学 海南省人民医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家杰出青年科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
比较基因组杂交芯片技术对肝癌组织中骨桥蛋白不同表达肿瘤细胞基因组的研究 被引量:6 2008年 目的探讨肝癌组织中骨桥蛋白(osteopontin,OPN)不同表达肿瘤细胞基因组的差异及其表达与临床病理特征的关系。方法免疫组化染色分析7l例肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的OPN表达,激光捕获显微切割和比较基因组杂交芯片分析肝癌中不同OPN表达肿瘤细胞基因组的改变。结果71例HCC中,OPN阳性表达29例(42.9%),表现为不均匀分布,阳性表达多位于癌巢周边、特别近肿瘤血管处,亦可见小癌结节呈广泛颗粒状表达,另有14例(19.7%)癌巢外的肝硬化组织呈OPN阳性染色;OPN过表达与肿瘤分化、脉管侵犯、肝内转移有关;OPN阳性与OPN阴性肿瘤细胞基因组相比有4q13.1q13.3、4q21.23—22.1、13q32.1-q32.3等拷贝数增加,其中阳性细胞中肿瘤相关基因如SMR3B、MUC7、EPHA5、SPP1(OPN)、CLDNIO等拷贝数明显增加。结论OPN提高肝癌细胞侵袭性而促进转移,可能与肿瘤细胞增殖、肝硬化的恶性转化有关。OPN阳性、阴性表达的肿瘤细胞之间存在肿瘤异质性。 武金才 孙冰生 刘道永 李国才 史炯 任宁 叶青海 钦伦秀关键词:肝细胞 骨桥蛋白 肿瘤异质性 肿瘤转移抑制基因HTPAP的Haploview单体型构建分析 被引量:1 2008年 目的通过单核苷酸多态性(SNP)检测对肿瘤转移抑制基因HTPAP进行单体型构建和分析。方法取100例肝细胞癌(HCC)新鲜标本,应用激光捕获组织显微切割获取纯肝癌细胞、提取DNA,对HTPAP基因上已登录的15个SNP位点进行检测,应用Haploview软件构建单体型。结果15个SNP位点中,有8个表现为单态、5个呈多态性、2个未能检测出。对100例肝细胞癌的该5个多态位点进行单体型构建后发现11种单体型,其中3种单体型(C-A-T-C-A、C-G-T-C-A和T-A-G-G-G)最常见,占87%,另外8种单体型占13%。4个SNP(rs7007097、rs3830326、rs1149、rs3739252)表现为强连锁不平衡关系,尽管rs11539529出现重组现象,但从整体看还是属于同一个单体型块。结论肿瘤转移抑制基因HTPAP在肝癌中常见C-A-T-C-A、C-G-T-C-A和T-A-G-G-G三种单体型,针对不同单体型研究分析可能为肝癌转移复发、预后预测提供新的途径和指标。 武金才 任宁 李国才 孙冰生 刘道永 史炯 戴春 董琼珠 孙海晶 叶青海 钦伦秀关键词:肝细胞 单核苷酸多态性 基因 干扰素α对肝癌细胞中转录因子Sp1的表达及活性的影响 被引量:2 2014年 目的:研究干扰素α对肝癌细胞中转录因子Sp1(specificity protein 1)的表达和活性的影响。方法:采用蛋白免疫印迹法分析干扰素α对肝癌细胞株MHCC97H中Sp1的表达及磷酸化水平的影响。采用凝胶电泳迁移率变动分析法检测干扰素α对Sp1活性的影响。结果:干扰素α可显著下调Sp1的表达和磷酸化水平,以对磷酸化水平的下调更为明显;干扰素α可显著抑制Sp1的活性。结论:Sp1可能作为干扰素α抗肝癌的临床疗效的预测指标。 潘奇 陈万勇 朱凯 张巨波 赵一鸣 朱小东 孙惠川 王鲁 任宁关键词:肝癌 转录因子 SP1 干扰素Α 转录因子Sp1表达与肝癌临床病理特征及预后的关系 被引量:5 2014年 目的:通过研究肝癌组织内转录因子Sp1的表达及其与肝癌患者临床病理特征及预后的关系,探讨转录因子Sp1作为肝癌预后预测指标的可行性。方法:对98例根治性切除术的肝细胞肝癌肿瘤组织芯片进行免疫组化检测Sp1的表达情况,分析其与肝癌患者临床病理特征及预后之间的关系。结果:免疫组化结果显示Sp1在肝癌组织中表达明显高于对应正常肝脏组织,在有微血管侵犯的患者中升高尤其明显。进一步分析显示Sp1表达与肝癌患者术后总体生存率呈负相关,而与肝癌患者术后复发率呈正相关。结论:转录因子Sp1在肝癌中明显高表达,可作为肝癌患者预后的独立预测指标。 潘奇 朱凯 陈万勇 张巨波 孙惠川 王鲁 任宁关键词:肝细胞肝癌 转录因子SP1 预后指标 组织芯片 肿瘤抑制基因HTPAP单体型构建及其与肝癌转移潜能的关系 2013年 目的探讨肝细胞癌(HCC)患者肿瘤组织DNA的HTPAP基因单体型与肝癌转移潜能的关系。方法提取864例HCC手术样本DNA,应用焦磷酸测序行SNPs检测,并予单体型构建,分析其与肝癌转移潜能的关系。构建HTPAP启动子单体型pGL3质粒,并分别转染MHCC-97H、HepG2肝癌细胞和正常的肝Hela细胞,分析不同HTPAP启动子单体型对基因转录活性的影响。结果共发现6个SNPs位点[-1053A/G、+64G/C、+357C/G、+1648-/TAAG(无插入和插入TAAG等位基因分别以T/G示,后同)、+1838A/G、+3528C/T]。单体型构建发现HTPAP中共存在11个单体型,其中AGCTAC、GCGGGT、AGCTGC、GCGGAT四种单体型占94.75%。临床病理特征分析提示单体型GCGGGT与高转移潜能正相关(P=0.0003)。启动子序列中两个SNPs(-1053AG和+64GC)存在完全LD,故只有三种启动子单体型(-1053AA/+64GG、-1053AG/+64GC GC和-1053GG/+64CC);双荧光报告法发现三种单体型的HTPAP启动子都具有显著转录活性,其中-1053AA/+64GG单体型启动子转录活性较-1053GG/+64CC和-1053AG/+64GC单体型启动子强,差异具有统计意义(P=0.005,0.009)。结论肿瘤转移抑制基因HTPAP的GCGGGT单体型与HCC高转移潜能正相关。HTPAP启动子单体型对基因的转录活性有显著影响并与术后复发密切相关,提示HCC中HTPAP的不同SNP单体型可能是潜在侵袭转移和复发预后的预测指标。 武金才 陈虒 董琼珠 贾户亮 任宁关键词:肝细胞 单核苷酸多态性 单体型 HTPAP单体型与基因表达及肝细胞癌(HCC)预后的关系 被引量:1 2013年 目的拟通过分析不同HTPAP单体型与基因表达及肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)预后的关系,探讨HTPAP单体型对HCC术后复发及预后的影响。方法随机选取377例HCC样本,提取其中以AGCTAC、GCGGGT、AGCTGC和GCGGAT等4种主要HTPAP单体型组成的HCC RNA。绝对定量PCR检测HTPAP基因表达水平,免疫组化染色、RT-PCR和Western blot检测HTPAP蛋白表达水平,分析单体型与基因表达的关系。随机选取665例HCC样本并提取DNA,焦磷酸测序方法对6个单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphisms,SNPs)进行检测。单体型构建后,分析HTPAP单体型与HCC预后的关系。结果 377例HCC中有327例由上述4种主要单体型构成。基因表达分析提示,HCC中HTPAP在GCGGGT纯合子组和AGCTAC/GCGGGT杂合子组的表达低于AGCTAC/GCGGAT杂合子组、AGCTAC/AGCTGC杂合子组及AGCTAC纯合子组,但差异无统计学意义(P=0.062)。免疫组化染色发现GCGGGT纯/杂合子组HCC较其他单体型HCC的HTPAP表达显著降低(P=0.035)。Kaplan-Meier分析提示,GCGGGT纯/杂合子组HCC较其他单体型HCC术后易复发且预后差(P<0.001)。Cox风险比例模型发现GCGGGT单体型是HCC术后复发及预后差的独立相关因子。结论 HCC的不同HTPAP单体型在mRNA水平的表达差异无统计学意义,但在蛋白水平存在显著差异。GCGGGT单体型可作为HCC术后复发和预后差的预测指标。 武金才 陈虒 李灼日 周开伦 贾户亮 任宁关键词:单体型 复发 预后