您的位置: 专家智库 > >

国家自然科学基金(10335070)

作品数:10 被引量:51H指数:5
相关作者:胡钧张晓东李海阔曹雪雁李民乾更多>>
相关机构:上海交通大学中国科学院上海应用物理研究所中国科学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金中国科学院“百人计划”上海市科委纳米专项基金更多>>
相关领域:生物学一般工业技术化学工程机械工程更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 7篇生物学
  • 2篇一般工业技术
  • 1篇化学工程
  • 1篇机械工程

主题

  • 3篇原子力显微镜
  • 3篇纳米
  • 3篇聚合酶
  • 3篇合酶
  • 2篇单分子
  • 2篇相互作用
  • 2篇纳米金
  • 2篇分子
  • 2篇AFM
  • 1篇单个DNA分...
  • 1篇等温
  • 1篇动力学
  • 1篇动力学研究
  • 1篇生化
  • 1篇生化过程
  • 1篇特异
  • 1篇特异性
  • 1篇忠实性
  • 1篇金纳米颗粒
  • 1篇聚合酶链式反...

机构

  • 7篇上海交通大学
  • 6篇中国科学院上...
  • 2篇中国科学院
  • 1篇宁波大学
  • 1篇中国科学院研...
  • 1篇中国科学院上...

作者

  • 6篇胡钧
  • 2篇陈润生
  • 2篇吕军鸿
  • 2篇李民乾
  • 2篇张晓东
  • 2篇曹雪雁
  • 2篇李海阔
  • 1篇周智磊
  • 1篇李雪玲
  • 1篇林继伟
  • 1篇雷晓玲
  • 1篇石宝晨
  • 1篇吕鸣
  • 1篇王鑫艳
  • 1篇米丽娟
  • 1篇陈恒
  • 1篇李宾
  • 1篇郭云昌
  • 1篇安红杰
  • 1篇方海平

传媒

  • 2篇科学通报
  • 2篇生物化学与生...
  • 2篇Scienc...
  • 1篇遗传
  • 1篇电子显微学报
  • 1篇Chines...
  • 1篇中国生物工程...

年份

  • 2篇2009
  • 3篇2007
  • 1篇2006
  • 3篇2005
  • 1篇2004
10 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
基于原子力显微镜的单个DNA分子压弹性测量被引量:3
2005年
介绍了一种基于振动模式扫描极化力显微镜在小力区(< 0.5 nN)测量柔软的生物分子压弹性的方法, 并利用此方法研究了DNA分子在直径方向(垂直于双螺旋方向)的压缩性质. 实验结果表明固定在云母表面的DNA分子具有很好的弹性, 在外力作用下DNA的径向形变可达到~50%, 当外力撤销后, 其形变可以完全恢复. 另外统计了20段DNA分子上20个点的高度与所受压力的关系, 并由此初步估算了DNA分子的弹性常数.
周星飞安红杰郭云昌孙洁林李民乾胡钧
关键词:原子力显微镜DNA
Direct measurement of compression spring constant of single DNA molecule with AFM被引量:4
2005年
In this paper, a new approach is demonstrated to measure the compression elasticity of single biomolecule in small force regime (<0.5 nN) using vibrating mode scanning polarization force microscopy (VSPFM). With this method we investigate the compression elasticity of a single DNA molecule in the radial direction (perpendicular to DNA strands). The radial deformation of DNA molecules deposited on mica surface is shown to be able to reach about 50% un der external load, and this remarkable deformation is re- versible. In addition, the compression spring constant of DNA molecules is estimated to be about 0.6 nN/nm according to the height-force curves.
ZHOUXinfeiANHongjieGUOYunchangSUNJielinLIMinqianHUJun
一种基于单分子纳米操纵的有序化测序策略被引量:2
2006年
尽管包括人类在内的许多生物物种的基因组测序工作已经完成,但由于现有测序技术的限制,大部分复杂基因组还存在很多大大小小的缺口.缺口的填补以及对其他重复序列区域的测序迫切需要全新的思路和技术.基于在DNA单分子定位切割和拾取方面的实验进展,提出了一种基于原子力显微镜纳米操纵技术的单分子有序化测序策略.计算机模拟的结果表明,这一方法和策略是可行的,有助于解决目前测序工作中所遇到的一些棘手问题.
吕鸣石宝晨李雪玲吕军鸿陈润生胡钧
关键词:DNA单分子原子力显微镜
纳米金增强复杂体系中PCR扩增低拷贝基因的反应特异性初步研究被引量:7
2009年
目的:利用纳米金颗粒提高复杂体系基因组低拷贝基因PCR扩增的反应特异性。方法:首先,模拟复杂基因组扩增模式体系,以接近单拷贝的λDNA为模板,在PCR过程中加入纳米金颗粒,设计优化实验,以便模拟建立复杂基因组低拷贝目的基因PCR扩增的模式体系。随后,扩增人类基因组的疾病相关的低拷贝基因模板(如人基因组肿瘤坏死因子基因外显子1的380bp),以检验纳米金优化增强PCR反应特异性的实际效果。结果:在复杂体系基因组的低拷贝基因PCR扩增中,纳米金颗粒能够较好地增强其PCR反应的特异性。结论:初步表明基于纳米金的纳米粒子PCR方法可以对复杂的实际基因组体系低拷贝基因的PCR扩增起到优化作用,这对于PCR反应优化方法的改进、推广具有重要的参考价值。
李海阔曹雪雁周智磊陈恒
关键词:聚合酶链式反应纳米金特异性
基于纳米操纵和单分子成像及分析技术的DNA与DNase I相互作用的表面机械生化过程和动力学研究
2009年
本文采用了"多步的改进的动态分子梳"纳米操纵技术(multi-step modified dynamic molecular combing,MMDMC)实现样品制备获得不同拉伸程度单个DNA分子,利用原子力显微镜重定位成像和单分子分析,对反应前后不同拉伸程度DNA分子的DNase I酶切产生缺口情况进行统计,在一定拉伸范围内讨论了在表面上DNaseI酶切反应速率变化的动力学信息。该不同拉伸程度的DNA与DNase I相互作用的表面机械生化过程对于生物分子多次反复相互作用研究体系具有代表性意义。
王鑫艳王化斌周化岚李海亓文鹏李宾张益胡钧
关键词:原子力显微镜DNASE
一种新的等温单向生长基因合成法初步探索被引量:3
2007年
基因合成正日益成为基因获取的一种有效手段。两种常用的基因合成方法是基于PCR的基因合成(P法)和基于连接酶的基因合成(L法)。这两种方法都不是独立于所合成基因的序列内容的。文章首次提出了一种新的基因合成策略-等温单向生长法(Isothermal Unidirectional Elongation Method,IUEM),在3种酶的作用下,DNA链在等温状态下单向串行延伸,直到获得目标基因。由于引物设计成特殊的发夹结构,该方法可以做到合成过程独立于或部分独立于目标基因的序列内容。本文探索了该策略的实验可行性,检测了影响基因合成的各种因素,并利用该方法成功地合成了一段254bp和一段300bp的DNA序列。
林继伟张晓东曹雪雁胡钧
关键词:基因合成等温发夹结构
Effect of temperature on the morphology of nanobubbles at mica/water interface被引量:6
2005年
The great implication of nanobubbles at a solid/water interface has drawn wide attention of the scientific community and industries. However, the fundamental properties of nanobubbles remain unknown as yet. In this paper, the temperature effects on the morphology of nanobubbles at the mica/water interface are explored through the combination of AFM direct image with the temperature control. The results demonstrate that the apparent height of nanobubbles in AFM images is kept almost constant with the increase of temperature, whilst the lateral size of nanobubbles changes significantly. As the temperature increases from 28℃ to 42℃, the lateral size of nanobubbles increases, reaching a maximum at about 37℃, and then decreases at a higher temperature. The possible explanation for the size change of nanobubbles with temperature is suggested.
张雪花李刚吴志华张晓东胡钧
关键词:NANOBUBBLESTEMPERATUREMORPHOLOGYAFM
Mechanism of the interaction between Au nano-particles and polymerase in nanoparticle PCR被引量:11
2007年
Nanoparticle PCR is a novel method to optimize DNA amplification. It performs well in improving specificity, enhancing sensitivity and speed. Several mechanisms were proposed in previous studies: one was based on the interaction between gold nanoparticles (AuNPs) and DNA while the other was attributed to the heat transfer property of AuNPs. In this paper, we propose that the interaction between AuNPs and DNA polymerase can significantly influence PCR. First, the addition of DNA polymerase can eliminate the inhibitory effects of excess AuNPs. Second, the addition of AuNPs will increase yield of the desired PCR product and make the optimum concentration of DNA polymerase move to higher value. Third, while excess polymerase might inhibit amplification efficiency, AuNPs can reverse this process and the yield of PCR amplification. Based on these results we propose a possible mechanism that AuNPs might modulate the activity of polymerase and improve PCR amplification.
MI LiJuanZHU HongPingZHANG XiaoDongHU JunFAN ChunHai
关键词:金纳米颗粒聚合酶
“纳米粒子PCR”中纳米金与聚合酶相互作用机制探讨被引量:15
2007年
“纳米粒子PCR”是一种新型的优化DNA扩增的方法,在提高扩增特异性,增加扩增灵敏度以及加快反应速度等方面展现了特殊的优化效果.研究发现在PCR反应中,聚合酶可以消除纳米金导致的抑制;而纳米金可以改变DNA聚合酶浓度-酶活性曲线的平衡点,增加DNA的合成量,同时高浓度聚合酶的活性可以通过添加纳米金得到恢复.在此基础上提出纳米金通过调控DNA聚合酶影响PCR反应的可能机制.
米丽娟朱红平张晓东胡钧樊春海
关键词:PCR纳米金聚合酶相互作用
单分子PCR产物错误率分析被引量:6
2004年
碱基错配致使PCR扩增产物中存在突变序列 .大量模板PCR扩增时突变序列所占的比例较低 ,对随后进行的PCR产物分析影响不大 ,但当对微量甚至单个模板DNA扩增时 ,情况则完全不同 .对单分子PCR产物的错误率进行了理论分析 ,结果表明 :根据实验目的和条件 。
王国华吕军鸿雷晓玲李海阔李民乾陈润生方海平胡钧
关键词:错误率忠实性
共1页<1>
聚类工具0