中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项项目(XJSYWFZX2009-08)
- 作品数：4 被引量：21H指数：2
- 相关作者：陈守才邓治李德军陈春柳闫洁更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院更多>>
- 发文基金：中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项项目国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 橡胶树死皮橡胶粒子膜蛋白差异分析与初步鉴定被引量：7
- 2010年
- 橡胶树死皮(tapping panel dryness,TPD)是制约天然橡胶生产的主要限制因子,在世界各橡胶种植园中普遍发生,给橡胶种植业带来严重的危害。目前仍无有效措施防治死皮发生,而橡胶树死皮发生分子机制是制定有效防治措施的前提。为阐明死皮发生的分子机制,应用双向凝胶电泳技术(2-DE),比较橡胶树死皮株与健康株橡胶粒子蛋白质组表达的差异。采用固相pH梯度双向凝胶电泳分离橡胶树死皮株与健康株橡胶粒子总蛋白质,经考染显色后,用PD Quest7.40图像分析软件进行比较分析,识别差异表达的蛋白质。差异点经过胶内酶切和基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析获取肽质指纹图谱(PMF),Mascot软件搜索SWISS-PROT和NCBI nr数据库鉴定蛋白质。经过上述分析共鉴定出13个蛋白差异表达点,与健康株相比,在死皮中上调表达的蛋白质点有11个,下调表达的蛋白质点有2个,这些差异表达的蛋白质可能在橡胶树死皮发生和发展过程中发挥重要作用。
- 陈春柳闫洁邓治陈守才李德军
- 关键词：巴西橡胶树死皮双向凝胶电泳橡胶粒子质谱
- 植物组织双向电泳样品制备方法研究进展被引量：12
- 2009年
- 双向电泳是目前应用最广泛的蛋白分离技术,该技术的核心是蛋白样品的制备。植物组织中通常含有大量蛋白酶和次生代谢物,这严重干扰蛋白提取、分离和鉴定。从植物组织中提取高质量的蛋白样品用于蛋白组分析充满挑战,简要阐述了植物组织蛋白提取的关键点,特别是植物组织中的次生代谢物及去除方案。此外,还对三种植物蛋白提取方法、三种方法的优缺点及适用植物组织作了概述。
- 李德军邓治陈春柳陈守才
- 关键词：双向电泳蛋白提取植物组织次生代谢物
- 巴西橡胶树核糖体蛋白S5基因的克隆及生物信息学分析被引量：2
- 2009年
- 核糖体蛋白S5是核糖体蛋白家族的重要成员,在核糖体中发挥重要作用。利用本实验室获得的部分序列设计引物,采用3'-RACE技术从巴西橡胶树胶乳中获得一个核糖体蛋白S5基因的完整阅读框,该基因编码209个氨基酸的多肽,含有一个典型的真核生物核糖体蛋白S5结构域。在HbRPS5氨基酸序列中没有预测到跨膜区和信号肽,二级结构分析表明HbRPS5属于混合型蛋白。对14个RPS5系统进化分析表明,巴西橡胶树的RPS5基因在进化上具有保守性,与植物类拟南芥的RPS5基因亲缘关系最近,而与人和酵母等亲缘关系相对较远。该基因的克隆和生物信息学分析为深入研究其功能奠定了基础。
- 李德军邓治陈春柳陈守才
- 关键词：巴西橡胶树基因克隆
- 巴西橡胶树核糖体蛋白S6基因的克隆及生物信息学分析被引量：1
- 2009年
- 核糖体蛋白S6是核糖体蛋白家族的重要成员,在核糖体中发挥重要作用。利用农业部橡胶生物学重点开放实验室获得的部分序列设计引物,采用3-′RACE技术从巴西橡胶树胶乳中获得一个核糖体蛋白S6基因的完整阅读框,该基因编码249个氨基酸的多肽,含有一个典型的真核生物核糖体蛋白S6结构域。在HbRPS6氨基酸序列中没有预测到跨膜区和信号肽,二级结构分析表明:HbRPS6属于混合型蛋白。对10个RPS6系统进化分析表明:巴西橡胶树的RPS6基因在进化上具有保守性,与植物类玉米的RPS5基因亲缘关系最近,而与动物和酵母的亲缘关系相对较远。该基因的克隆和生物信息学分析为深入研究其功能奠定了基础。
- 李德军邓治陈春柳陈守才
- 关键词：巴西橡胶树基因克隆
