国家教育部博士点基金(20096202110002)
- 作品数：2 被引量：16H指数：2
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- 祁连山不同海拔梯度山生柳遗传多样性的SSR分析被引量：7
- 2012年
- 本实验采用SSR分子标记技术,对甘肃祁连山脉9个海拔梯度共180个单株的山生柳遗传多样性和遗传结构进行了研究。利用杨属植物的47对SSR引物对山生柳进行了通用性分析,筛选出15对重复性高、条带清晰的引物,结果显示,15条引物共检测到211条谱带,其中多态性条带有176条,平均每个引物检测到11个等位变异,多态位点比率(P)为85%。应用分析软件Popgen 32进行分析得出:在物种水平上,Shannon多样性指数(I)为0.419 2,Nei基因多样性指数(H)为0.279 6;基因分化系数Gst为0.093 5,基因流Nm为4.848 7,说明山生柳遗传分化大部分存在于相同海拔梯度内。P,H,I都反应出山生柳具有较高的遗传多样性。聚类分析显示,遗传距离与空间地理距离有显著相关性。海拔及纬度因子显著影响山生柳种群的遗传多样性水平,海拔梯度越高,山生柳的遗传多样性越丰富。
- 郭敏马彦军李毅
- 关键词：SSR海拔
- 山生柳SSR-PCR反应体系优化被引量：9
- 2012年
- 本研究以祁连山4个海拔梯度的山生柳(Salix oritrepha)为材料,采用L9(34)正交试验设计和单因子试验,分析山生柳SSR技术中PCR体系的主要成分对扩增结果的影响,并对引物SHUK123的适宜退火温度进行优化。结果表明,PCR反应体系的最佳条件:20μL体系中2.0mmol·L-1 Mg2+1μL,0.10mmol·L-1 dNTPs1.5μL,0.5UTaq酶用量为1μL,20ng·μL-1 DNA模板1μL,0.5μmol·L-1的上下游引物各2μL,10×TaqBuffer 2μL,ddH2O加至20μL。扩增反应程序:94℃高温预变性时间3min,94℃变性45s,Tm(不同退火温度)退火时间45s,72℃延伸30s,循环数30个,最后72℃后延伸时间5min,4℃保温。适宜退火温度为56℃。以上结果表明,此反应体系在山生柳PCR扩增中的稳定性和可重复性较好。
- 郭敏李毅马彦军
- 关键词：SSR-PCR
