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国家自然科学基金(41306128)

作品数:11 被引量:14H指数:2
相关作者:张俊玲施志仪孙文慧吴继魁李燕更多>>
相关机构:上海海洋大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金上海市自然科学基金更多>>
相关领域:生物学农业科学理学更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 5篇生物学
  • 4篇农业科学
  • 2篇理学

主题

  • 7篇牙鲆
  • 7篇基因
  • 2篇性腺
  • 2篇基因表达
  • 2篇分子
  • 2篇分子特征
  • 2篇高温
  • 2篇UTR
  • 1篇蛋白
  • 1篇电荷
  • 1篇电荷转移
  • 1篇电化学
  • 1篇电化学生物传...
  • 1篇电化学阻抗
  • 1篇电化学阻抗谱
  • 1篇定点诱变
  • 1篇性发育
  • 1篇性激素
  • 1篇性腺发育
  • 1篇衍生化

机构

  • 10篇上海海洋大学

作者

  • 9篇张俊玲
  • 7篇施志仪
  • 2篇吴继魁
  • 2篇孙文慧
  • 1篇付元帅
  • 1篇李燕
  • 1篇印翠
  • 1篇于善坤
  • 1篇张红梅
  • 1篇孙文慧

传媒

  • 3篇基因组学与应...
  • 2篇生物技术通报
  • 2篇上海海洋大学...
  • 1篇海洋渔业
  • 1篇江苏农业学报
  • 1篇水产科学

年份

  • 5篇2019
  • 1篇2018
  • 1篇2017
  • 2篇2016
  • 1篇2015
11 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
牙鲆dazl基因的克隆与表达分析被引量:2
2016年
dazl(deleted in azoospermia-like)基因是多种物种精子发生的重要调控因子,为探讨该基因在牙鲆(Paralichthys olivaceus)性腺发育分化中的作用,本研究采用同源克隆和RACE技术克隆了牙鲆dazl基因的cDNA序列,利用生物信息学方法分析了其序列结构,并利用实时荧光定量PCR技术检测了该基因在牙鲆成体组织和早期发育阶段的表达情况。结果发现:牙鲆dazl cDNA序列全长2 031 bp,包括105 bp的5'端非翻译区,1 275 bp的3'端非翻译区和编码217个氨基酸残基的651 bp开放阅读框;氨基酸同源序列比对显示该序列存在一个高度保守的RRM(RNA recognition motif)结构域,且该结构域在鱼类中具有100%的序列一致性;荧光定量PCR结果显示dazl基因主要在牙鲆性腺中表达,且在精巢中的表达高于卵巢;在牙鲆早期发育阶段,dazl基因在未受精卵、受精卵及囊胚期均有较高的转录本,而在原肠胚期表达开始降低,至孵化后3 d一直保持较低的水平,这些丰富表达的母源性dazl mRNA可能参与了胚胎发育中原始生殖细胞的形成。本研究为进一步阐明dazl基因在牙鲆生殖发育中的功能奠定了基础。
孙近近张俊玲孙文慧施志仪
关键词:牙鲆DAZLCDNA克隆基因表达
牙鲆cbx2基因的分子特征与组织表达被引量:2
2019年
为鉴定牙鲆(Paralichthys olivaceus)色素框同源蛋白(Chromobox homolog,CBX)基因cbx2及探讨其在牙鲆性腺中的表达,通过PCR克隆和测序获得了cbx2 cDNA序列;利用多种生物信息学方法在线分析了牙鲆CBX2蛋白质的理化性质与空间结构,并比较了脊椎动物中cbx2的基因结构、氨基酸同源性、系统进化;运用RT-PCR技术分析了cbx2基因在牙鲆成体不同组织的表达情况。结果表明获得的牙鲆cbx2 cDNA序列包含1 584 bp的开放阅读框,编码527个氨基酸,其蛋白质分子量和等电点分别为56 578.98和10.03,是一种偏碱性的亲水性蛋白,该蛋白无信号肽,无跨膜区域,且编码该蛋白的氨基酸中以丝氨酸(Sr)的含量为最高;空间结构分析发现,牙鲆CBX2蛋白以α螺旋和无规则卷曲为主,其二级结构中含有1个染色质结构域和4个低复杂结构域,该染色质结构域常结合甲基化氨基酸残基。基因结构、氨基酸同源性和系统进化分析表明cbx2基因在脊椎动物进化中较为保守,牙鲆cbx2与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、青鳉(Oryzias latipes)的基因结构更为相似,其氨基酸同源性与杜氏鰤(Seriola dumerili)最高,为89%。RT-PCR结果显示牙鲆cbx2基因在精巢的表达量最高,卵巢次之,而在其他组织中仅有较低的表达。这些结果提示了cbx2基因在牙鲆的性腺发育中可能具有重要作用。
王新艳张俊玲施志仪
关键词:牙鲆性腺生物信息学分析RT-PCR
牙鲆fmr1基因的分子特征与表达分析
2019年
脆性X智力低下1号基因(fragile X mental retardation 1,fmr1)编码的蛋白FMRP是一种RNA结合蛋白,当fmr1基因缺失时雌鼠卵巢中卵泡数目减少、生殖功能会降低。牙鲆(Paralichthys olivaceus)是中国重要的海水经济鱼类,其性腺发育一直颇受关注。为了探讨fmr1基因在牙鲆性腺发育中的作用,本研究运用生物信息学方法分析了fmr1基因的分子结构与进化特征,并采用荧光定量PCR技术检测了其在牙鲆发育中的表达情况,探讨了高温对牙鲆性腺分化中fmr1基因表达的影响。结果表明,牙鲆fmr1基因含有15个外显子和14个内含子,存在两个高度保守的KH(hnRNP K homology)结构域,该结构域是RNA结合蛋白的特征结构域。共线性及系统进化分析表明fmr1在鱼类中进化关系相对保守。荧光定量PCR结果显示fmr1在牙鲆成鱼雌雄性腺中表达量相对较高,且在卵巢中表达量最高;在不同发育时期中,fmr1在神经胚期表达量最高;且高温处理对fmr1在性腺分化早期的表达有一定的抑制作用。这些结果暗示了fmr1基因可能在牙鲆性腺发育中发挥着重要的作用。
向玉婷张俊玲王新艳施志仪
关键词:牙鲆FMR1性腺发育高温
牙鲆kiss2基因的分子鉴定及表达分析
2016年
为克隆与牙鲆生殖相关的神经内分泌因子kiss2基因,并检测该基因在牙鲆成体不同组织及早期不同发育阶段的表达变化,本研究采用Trizol法提取牙鲆成鱼各组织及早期不同发育阶段样品总RNA;参照其他物种的kiss2 c DNA序列,设计并合成kiss2引物进行PCR扩增;运用实时荧光定量PCR检测kiss2基因在牙鲆成鱼各组织及早期不同发育阶段的表达情况。结果成功地获得长度为449 bp的牙鲆kiss2 c DNA序列,其中编码区序列为366 bp,编码121个氨基酸。在该序列中发现了高度保守的"FNYNPLTLRF"序列,此序列可以调节促性腺激素释放激素和黄体生成素的合成与释放。定量PCR结果显示,牙鲆kiss2基因在脑组织中的表达量最高,在卵巢和精巢中也均有表达;牙鲆kiss2基因在胚胎阶段表达量相对较低,而在孵化后第7 d其表达量显著增高,且在孵化后的第29 d达到高峰。说明牙鲆kiss2基因具有明显的时期和组织差异性表达,其在牙鲆脑中的丰富表达及在精巢和卵巢中的表达表明该基因可能在牙鲆神经系统与生殖中发挥重要作用。
于善坤张俊玲施志仪付元帅张红梅
关键词:牙鲆发育表达
基于DNA双链电荷转移的Hg^(2+)电化学生物传感器的研究被引量:6
2017年
基于DNA双链电荷转移原理,利用胸腺嘧啶(thymine)与Hg^(2+)的特异性识别和计时电量法构建了一种高灵敏检测水溶液中Hg^(2+)的电化学生物传感器。该传感器将含有1个T-T碱基错配对的DNA互补双链通过Au-S键自组装在金电极表面,运用计时电量法在含有亚甲基蓝的铁氰化钾溶液中进行测定。T-T错配阻断了DNA双链内部电荷转移,而Hg^(2+)通过T-Hg^(2+)-T配位作用与双链DNA特异性结合并形成DNA双链内部电荷转移通路,引起电极表面计时电量的变化。计时电量测定结果显示:在亚甲基蓝的还原峰电位(-380m V)附近,计时电量随着溶液中的Hg^(2+)浓度的增大而增加,Hg^(2+)浓度在1.0 nmol/L^104nmol/L范围内,计时电量的变化量与Hg^(2+)浓度的对数呈良好的线性关系,线性相关系数(R2)为0.997,检测限为0.5 nmol/L(S/N=3)。干扰实验表明,该传感器对Hg^(2+)具有良好的特异性和选择性。
禹亚莉李燕张俊玲吴继魁
关键词:生物传感器计时电量法电化学阻抗谱
应用于miRNA靶标检测的双荧光素酶报告载体的构建及鉴定被引量:3
2015年
以牙鲆空通气孔同源框2基因(empty spiracles homeobox 2,emx2)为例,构建包含emx2 3'UTR区的野生型和突变型双荧光素酶重组报告表达载体,以期应用于mi RNA靶标的检测。利用Trizol法提取牙鲆成鱼精卵巢混合组织总RNA,参照已克隆出来的emx2基因c DNA序列,设计并合成emx2 3'UTR片段的引物并进行PCR扩增,将得到的基因片段和psi CHECK-2载体双酶切后,用T4 DNA Ligase酶进行连接反应,并转化入DH5α感受态细胞,筛选后得到野生型重组质粒;同时采用定点诱变法对emx2基因进行体外定点诱变并采用同样的方法形成突变型重组质粒。对野生型和突变型重组质粒进行双酶切、琼脂糖凝胶电泳鉴定及测序分析。成功克隆了emx2 3'UTR区,并将emx2 3'UTR区的mi RNA靶点序列GACTTGA突变为AGTCCAG,成功构建了野生型和突变型包含emx2 3'UTR区的mi RNA靶标检测载体。通过RT-PCR、基因重组及定点诱变技术成功构建了应用于mi RNA靶标验证的野生型和突变型双荧光素酶报告载体psi CHECK-emx2-3'UTR和psi CHECK-mutated-emx2-3'UTR。
印翠张俊玲施志仪孙文慧孙近近
关键词:牙鲆MIRNA定点诱变
高温与性激素诱导对褐牙鲆kiss2和gpr54-2基因表达的影响
2018年
Kisspeptin是调控脊椎动物生殖的重要神经内分泌因子,本实验室先前已鉴定了褐牙鲆kiss2及其受体gpr54-2基因,二者在褐牙鲆脑和性腺中具有较高表达,但其在褐牙鲆早期性腺分化中的作用以及温度、外源激素对其基因表达的影响尚不清楚。因此本研究设置高温(28℃)、雌激素(10μg/L)、雄激素(10μg/L)处理组和常温(20℃)对照组培育性腺分化早期的褐牙鲆幼鱼(45日龄、55日龄和65日龄),利用荧光定量PCR技术分析了高温和性激素诱导对褐牙鲆早期性腺分化过程中kiss2及其受体gpr54-2基因表达的影响。试验结果显示,高温和雌激素处理可以促进褐牙鲆脑中kiss2和性腺中gpr54-2的表达,却下调了褐牙鲆性腺中kiss2的表达;而雄激素处理则使褐牙鲆脑和性腺中kiss2和gpr54-2的表达几乎都受到显著的抑制作用。本研究结果为进一步阐述kiss2和gpr54-2基因在褐牙鲆早期性腺分化中的作用奠定基础。
向玉婷张俊玲施志仪
关键词:褐牙鲆高温性激素
藻红蛋白衍生比率荧光法检测消毒液中邻苯二甲醛被引量:1
2019年
基于R-藻红蛋白(R-PE)与邻苯二甲醛(OPA)的衍生化反应,构建一种新型检测邻苯二甲醛的荧光比率型探针。R-藻红蛋白经十二烷基硫酸钠(SDS)去折叠后裸露出伯氨基团,之后在β巯基乙醇存在的碱性环境中,与邻苯二甲醛相互反应衍生出一种蓝色荧光的异吲哚类化合物。在该体系中,随着邻苯二甲醛浓度的增加,R-藻红蛋白本身的荧光信号逐渐减弱,衍生产物的蓝色荧光信号逐渐增强,从而构成了比率型荧光探针。结果表明:在pH 10.5的碳酸盐缓冲条件下,探针的最佳检测时间为3~6 min,线性检测范围为5~100μg/mL,相关系数R2为0.992,最低检测限为1.7μg/mL。该探针应用于市售洗手液样品测定,加标回收结果满意。
任宁娜贾敏吴继魁
关键词:邻苯二甲醛R-藻红蛋白衍生化反应消毒液
PcG家族CBX2基因的发现及其在哺乳动物性发育中的作用被引量:1
2019年
Polycomb group complex (PcG)作为发挥转录抑制作用的重要表观遗传调控复合物参与发育、衰老以及肿瘤发生等重要生理过程。Pc G家族成员,包括PRC1 (Polycomb repressive complex 1)与PRC2 (Polycomb repressive complex 2)两种复合物,各组分间功能既协同,又不失特性,色素框同源蛋白(Chromobox homolog CBX)是PRC1的主要核心蛋白,其家族的成员之一CBX2近年来成为研究的热点。本研究综述了CBX2基因的发现、基因和蛋白质的结构组成及其在人和鼠不同组织的表达情况,阐述了CBX2在哺乳动物性发育中的作用及研究进展,发现CBX2除参与PcG复合体发挥转录抑制作用外,还具有基因转录激活作用,它作为哺乳动物性别决定级联中SRY (Sex region of Y chromosome)的上游基因可直接激活靶基因SF1/NR5A1的表达,如果CBX2基因突变或缺失将使雄性小鼠发生性反转,在人类中造成46,XY性发育障碍(disorders of sex development, DSD),为进一步研究CBX2基因在动物性发育调控中的作用提供依据。
王新艳向玉婷张俊玲施志仪
关键词:PCG性发育
应用于pol-miR-26a,26b靶基因检测的psiCHECK-dmrt1-3'UTR报告质粒的建立
2019年
为明确牙鲆雄性性别相关关键基因dmrt1 (doublesex and mab-3-related transcription factor 1)是否为pol-miR-26a、pol-miR-26b作用的靶基因,本研究利用PCR技术克隆了dmrt13'UTR区,并成功引入了特殊限制性内切酶PemⅠ和NotⅠ的识别位点;将得到的dmrt1 3'UTR区片段和psiCHECK-2载体进行双酶切、连接后得到野生型重组质粒;并且利用定点诱变法对dmrt1 3'UTR区进行体外定点诱变,将pol-miR-26a、pol-miR-26b识别的靶序列ACTGAA突变为TGACTT,形成突变型重组质粒。经琼脂糖凝胶电泳鉴定、双酶切及测序分析,成功获得了可用于pol-miR-26a、pol-miR-26b的靶基因dmrt1验证的野生型psiCHECK-dmrt1-3'UTR和突变型psiCHECK-mutated dmrt1-3'UTR的报告质粒,为进一步研究pol-miR-26a、pol-miR-26b的靶基因dmrt1鉴定和功能奠定了基础。
徐明琴王前龙王新艳张俊玲孙文慧向玉婷
关键词:牙鲆DMRT1
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