国家自然科学基金(30901969)
- 作品数：3 被引量：19H指数：3
- 相关作者：孙鹏李先恩臧亚超杨太新赵春丽更多>>
- 相关机构：中国医学科学院北京协和医学院河北农业大学黑龙江中医药大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生生物学更多>>
- 地黄microRNAs和靶基因的生物信息学预测及验证被引量：8
- 2014年
- 目的拟利用地黄Rehmannia glutinosa EST数据通过生物信息学手段预测新的地黄microRNAs(miRNA),为今后地黄miRNA的生物学研究奠定基础。方法根据miRNA家族在不同物种中的保守性,将miRBase数据库中的已知植物miRNA与通过高通量测序获得的93 172条地黄EST序列进行同源比对,按照miRNA前体应具备的标准进行筛选。结果预测到分属于8个家族的8条潜在地黄miRNA序列,并通过实时荧光定量PCR对8条预测的miRNA进行了检测,证实8条miRNA在地黄中真实存在。随后利用软件对8条地黄miRNA的靶基因进行预测,发现其靶基因主要编码与地黄生长发育、代谢以及胁迫响应等过程相关的蛋白。结论新预测的地黄miRNA及其靶基因为今后研究它们在地黄中的生物学功能奠定了基础。
- 赵春丽李先恩都晓伟孙鹏
- 关键词：地黄MICRORNA靶基因生物信息学PCR检测
- 地黄扩展蛋白基因RgExpA1的克隆与表达分析被引量：10
- 2012年
- 采用RT-PCR方法对9个地黄扩展蛋白基因在地黄不同组织器官、不同发育时期的表达特点进行了分析,在此基础上用RACE方法克隆了主要在根中表达的RgExpA1基因的全长,并对该基因编码氨基酸的功能位点、拼接方式以及与同源基因的进化关系作了初步分析。
- 臧亚超孙鹏杨太新李先恩
- 关键词：基因克隆
- 农杆菌介导的地黄遗传转化体系的优化被引量：4
- 2012年
- 旨在通过对农杆菌介导的地黄遗传转化体系影响因子的研究,探索最佳转化条件,为建立高效地黄遗传转化体系奠定基础。利用正交实验,通过检测地黄叶片中gus基因瞬时表达情况,对地黄遗传转化效率的决定因子进行了系统研究。正交试验结果表明,地黄遗传转化过程对转化效率影响程度从高到低的因素依次为:共培养时间、预培养时间、菌液浓度和侵染时间;以地黄叶片为外植体,材料不经过预培养,菌液OD600值为0.6,侵染时间5min,并在培养基中添加100μmol/L乙酰丁香酮,共培养3天条件下可达最高转化效率,gus基因瞬时表达率可达65.63%。通过对根癌农杆菌介导的地黄遗传转化体系的优化,建立了高效的瞬时表达转化体系。
- 臧亚超杨太新李先恩孙鹏
- 关键词：地黄GUS
