中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1630062013014)
- 作品数:3 被引量:11H指数:3
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- 割手密铜锌超氧化物歧化酶基因(SsSOD-1a)的克隆与分析被引量:3
- 2015年
- 本文以高粱超氧化物歧化酶基因(NCBI登录号为XM 002445626.1)c DNA序列为探针,对甘蔗EST数据库进行同源检索、筛选和拼接,通过分子克隆和序列分析验证,获得了1个割手密铜锌超氧化物歧化酶基因全长c DNA序列(Ss SOD-1a,Gene Bank登录号为KJ002571)。序列全长703 bp,由624 bp的开放读码框,36 bp的5’非翻译区和43 bp的3’非翻译区组成,编码207个氨基酸。氨基酸保守结构域分析表明,该蛋白序列具有铜锌超氧化物歧化酶保守结构域,属于SOD家族。氨基酸同源性分析发现,割手密Ss SOD-1a蛋白序列与鹰嘴豆、高粱、玉米等物种同源关系较近。
- 姚艳丽胡小文邢淑莲徐磊张树珍刘洋
- 关键词:割手密超氧化物歧化酶PCR
- 水分胁迫对甘蔗、割手密和斑茅抗氧化酶活性的影响被引量:7
- 2013年
- 水分胁迫条件下,研究甘蔗、割手密和斑茅超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)的变化。结果表明,割手密SOD、POD和CAT活性随着水分胁迫时间的延长呈上升趋势,分别在水分胁迫后6天和7天达到最大值;斑茅的SOD和POD活性整体也表现为上升趋势,但其波动幅度较大;CAT活性表现为先升后降的变化趋势。随着干旱胁迫时间的延长,甘蔗品种ROC22的SOD表现为先降后升的变化趋势,POD和CAT均表现为下降的变化趋势。
- 姚艳丽邢淑莲徐磊胡小文刘洋
- 关键词:甘蔗割手密斑茅水分胁迫抗氧化酶
- 斑茅铜锌超氧化物歧化酶基因(SaSOD-1)的克隆与序列分析被引量:3
- 2015年
- 斑茅是甘蔗近缘野生种之一,具有较强的抗逆性,研究并开发利用斑茅的强抗逆基因,对甘蔗育种具有重要意义。本研究以高粱Cu/Zn-SOD(登录号:XM 002445626.1)cDNA序列为探针,对甘蔗属EST数据库进行检索、比对、拼接,通过设计特异引物,PCR扩增和序列分析验证,克隆得到2个Cu/Zn-SOD(SaSOD-1a和SaSOD-1b,登录号:KJ001795和KJ001796)基因全序列,其中SaSOD-1a基因组序列全长2 473 bp,SaSOD-1b基因组序列全长2 228 bp,均有8个外显子,7个内含子,其cDNA序列长度均为692 bp,编码206个氨基酸。序列比较分析表明,SaSOD-1a和SaSOD-1b序列相似性为98.6%,有8个单核苷酸多态性位点,蛋白质相似性为99.0%,2个氨基酸变异位点。用推导出的氨基酸序列与其它植物做同源进化分析,与高粱、玉米、谷子等比较均表现出较高的保守性。研究结果可为进一步了解超氧化物歧化酶与斑茅耐旱性的关系奠定基础。
- 姚艳丽邢淑莲胡小文徐磊刘洋
- 关键词:斑茅铜锌超氧化物歧化酶