国家自然科学基金(30371087)
- 作品数：5 被引量：32H指数：3
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- 相关机构：浙江省农业科学院浙江大学福建农林大学更多>>
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- 家蚕磷酸甘油醛异构酶Tpi基因的克隆被引量：5
- 2005年
- 利用生物信息学方法成功地克隆了家蚕磷酸甘油醛异构酶 (triosephosphate isomerase Tpi) 基因 (GenBank登记号为AY734490).该基因全长为2 875 bp;含有5 个外显子、4个内含子,所有内含子/外显子边界都符合典型的GT/AG剪切模式;cDNA 序列全长1 051 bp,并经RT-PCR克隆和序列分析进行了验证;具有完整的开放阅读框架(ORF,95～839 bp),可编码248个氨基酸的蛋白.通过与NCBI蛋白数据库的比对表明,该基因编码的蛋白为磷酸甘油醛异构酶(EC 5.3.1.1),参与葡萄糖分解代谢,即将磷酸二羟丙酮转化为3-磷酸甘油醛,在果蝇、蚊子、黄粉虫、美洲淤夜蛾、棉铃虫等昆虫中具有高度的保守性.
- 牛宝龙孟智启翁宏飙沈卫锋吕顺霖
- 关键词：EST数据库PCR家蚕
- 家蚕MLP基因的克隆及其结构分析被引量：2
- 2007年
- 利用生物信息学的方法快速获得家蚕MLP(Muscle LIM protein,MLP)基因cDNA电子序列,经RT-PCR生物验证正确,登录GenBank(No.DQ311195)。MLP基因cDNA长2327bp,ORF全长1485bp,编码产生494个氨基酸。该MLP基因组DNA含有11个外显子,10个内含子,所有内含子/外显子边界都符合典型的GT/AG剪切模式。MLP基因编码的蛋白富含Gly(14.4%),分子量约为53.03kDa,等电点(PI)为8.29。通过BLAST分析发现该基因编码的家蚕肌肉LIM蛋白,含有5个保守的LIM结构域,家蚕的另一种LIM蛋白(AAR23823)含一个LIM结构域,两者可能是通过可变剪切产生;后者可能通过竞争作用调节前者在肌细胞中的功能。MLP的克隆为进一步研究其体内功能奠定了基础。
- 刘岩牛宝龙翁宏飚沈卫锋何丽华齐晓朋孟智启
- 关键词：家蚕MLPLIM结构域
- 抗菌肽天蚕素B对铜绿假单胞菌感染小鼠创面的抗菌作用被引量：3
- 2006年
- 目的观察抗菌肽天蚕素B对小鼠铜绿假单胞菌感染创面的抗菌效果。方法于30只ICR小鼠背部切除全层皮肤(创面为1 cm×1 cm),将铜绿假单胞菌菌液涂抹于创面制成感染模型,并随机分为对照组、磺胺米隆组、抗菌肽组,伤后3 h分别用含等渗盐水、100 g／L磺胺米隆溶液、1g／L天蚕素B的纱布湿敷,每组10只。伤后1～4 d对各组小鼠创面行大体观察;伤前和伤后4 d测量体温,抽取血液观察白细胞变化;伤后4 d检测痂下肌肉组织细菌定量和观察存活情况。结果对照组创面分泌物多、创面潮湿;磺胺米隆组、抗菌肽组创面结痂、干燥、无明显分泌物。各组小鼠术后体温多数上升、白细胞计数均减少。抗菌肽组痂下肌肉组织细菌定量为(42±50)集落形成单位(CFU)／g,明显少于磺胺米隆组(886±804)CFU／g(P<0．05),两组均明显低于对照组(41±28)×105CFU／g(P<0．01)。对照组小鼠伤后4 d存活数明显少于抗菌肽组、磺胺米隆组(P<0．05)。结论天蚕素B对ICR小鼠铜绿假单胞菌感染创面有明显的抗感染作用,可明显降低其死亡率。
- 任海涛韩春茂张嵘徐志江孟智启翁宏飚牛宝龙
- 关键词：伤口感染天蚕素B
- 利用EST库资源克隆家蚕腺苷酸转移酶基因被引量：20
- 2004年
- 根据物种间同源基因相对保守的特点 ,利用生物信息学方法以果蝇 (Drosophilamelanogaster)腺苷酸转移酶基因 (adeninenucleotidetranslocase,ant)cDNA序列作为模板 ,对家蚕 (Bombyxmori)EST数据库进行同源检索筛选 ,克隆了家蚕腺苷酸转移酶基因的cDNA序列 (GenBank登录号为AY2 2 70 0 0 ) ,全长为 1936bp ,并经RT PCR克隆、序列分析验证 ,结果与电子克隆序列完全一致。该cDNA序列具有完整的开放阅读框架 (ORF ,2 0 7～ 110 9bp) ,推测编码蛋白为 30 0个氨基酸 ,通过与烟草天蛾 (Manducasexta)、蜜蜂 (Apismellifera)、绿蝇 (Luciliacuprina)、果蝇、蚊子(Anophelesgambiae)等昆虫的腺苷酸转移酶蛋白序列比较 ,发现该基因具有高度的保守性。表明根据物种间同源基因序列 ,对跨物种间EST数据库进行同源检索筛选、拼接 ,是基因克隆的一条有效途径。
- 陈大福牛宝龙翁宏飚孟智启吕顺霖
- 关键词：家蚕EST数据库RT-PCR
- 家蚕Bm Tpi基因Z染色体定位被引量：4
- 2005年
- 采用实时定量PCR技术,以家蚕Bombyxmori第11号染色体上的DH-PBAN基因为参照基因,检测家蚕不同个体间BmTpi基因与常染色体上DH-PBAN基因的拷贝数之比,雄体BmTpi∶DH-PBAN=1.0,雌体BmTpi∶DH-PBAN=0.5;并用已经定位于Z染色体上的BmKettin基因为参照,检测BmTpi基因的拷贝数与BmKettin基因的拷贝数之比,雄体BmTpi∶BmKettin=1.0,雌体BmTpi∶BmKettin=1.0,证明BmTpi基因在家蚕基因组中的拷贝数与BmKettin基因相同,说明BmTpi基因位于Z染色体上。
- 牛宝龙吕顺霖翁宏飚沈卫锋孟智启
- 关键词：BMZ染色体实时定量PCR
- 利用EST数据库资源克隆家蚕（Bombyx mori）磷酸甘油醛异构酶基因
- 利用生物信息学方法成功地克隆了家蚕磷酸甘油醛异构酶（triosephosphate isomerase Tp（?）） 基因（GenBank 登记号为AY734490）,全长为2,875 bp;含有5个外显子、四个内含子,...
- 牛宝龙孟智启翁宏飙沈卫锋吕顺霖
- 关键词：EST数据库家蚕
- 文献传递
