广西壮族自治区自然科学基金(0447049)
- 作品数:3 被引量:10H指数:2
- 相关作者:梁浩张志勇吴华罗皓邢辉更多>>
- 相关机构:广西医科大学中国疾病预防控制中心柳州市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:广西壮族自治区自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 广西HIV-1 CRF01-AE重组毒株env基因V3环序列变异及其与生物表型的关系被引量:8
- 2006年
- 目的研究广西HIV-1 CRF01-AE重组毒株env基因V3环序列变异及其与生物表型间的关系。方法从广西主要流行区收集来的50份HIV-1感染者血液样本中提取前病毒DNA,使用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)扩增HIV-1 env基因片段并进行亚型鉴定,选择38份CRF01-AE重组型HIV-1毒株env基因V3环及邻近区域的序列进行系统树和氨基酸变异分析。结果38份CRF01- AE重组毒株中36份与分离于广西地区的CRF01-AE.97CNGX2f和泰国代表毒株THCM240接近,另外2份与中非共和国代表株90CF402聚成一簇;CRF01-AE重组毒株V3环顶端四肽存在着4种类型: GPGQ、GPGR、GPGH和GPGA;根据V3环关键氨基酸推测辅助受体使用情况,结果显示:71.05%的CRF01-AE重组毒株可能使用CCR5作为辅助受体,28.95%不能对其辅助受体的使用情况做出预测。结论广西HIV-1 CRF01-AE重组毒株V3顶端四肽变异较大,而且大部分毒株可能为NSI型,这可为广西该毒株的防治和诊断试剂的更新提供参考。
- 罗皓梁浩邵一鸣张志勇邢辉卢灿健吴华
- 关键词:人类免疫缺陷病毒1型
- 一种简易的HIV-1病毒载量定量筛查方法的建立被引量:2
- 2014年
- 目的 建立一种基于RT-PCR法的简易的HIV-1感染者或艾滋病患者血浆病毒载量筛查方法.方法 在广西南宁市采集18例HIV-1感染者和18例阴性对照者血液标本,提取RNA,以引物LTR-1/LTR-2对待测样本进行PCR扩增,获得Ct值.同时,应用Nuclisens EasyQ HIV-1 v1.2法作为对照对这些样本进行病毒载量检测.对Ct值与病毒载量之间进行相关性分析,获得相应的回归方程.结果 待测样本中HIV-1感染者Ct值在29.103~31.610个循环之间,阴性对照者未能扩增出产物.RT-PCR法Ct值与Nuclisens EasyQ HIV-1 v1.2法检测出的病毒载量对数值之间具有良好的线性关系(r=-0.51,P=0.03),回归方程为logY(viral road)=57.55-1.56×(Ct value).结论 所建立的HIV-1病毒载量RT-PCR检测方法操作简单,价格便宜,与商业化试剂盒具有较好的一致性,可用于HIV-1感染定量筛查.
- 廖艳研蒋俊俊黄颉刚梁冰玉周波潘沛江苏锦明李彧梁浩叶力
- 关键词:病毒载量逆转录聚合酶链反应
- 应用多重巢式PCR法快速鉴定广西HIV-1主要亚型
- 2009年
- 目的建立快速鉴定广西HIV-1主要流行亚型CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B和C的多重巢式PCR方法。方法针对HIV-1gag基因设计CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B和c亚型特异性引物,建立多重巢式PCR法,用该法鉴定来自广西的HIV-1毒株的亚型,并与基因测序法的鉴定结果比较。结果多重巢式PCR法能正确鉴别5种已知亚型的样本,10份HIV阴性样本均无扩增,在72份未知亚型样本中,正确鉴定出66份,分别属于CRF01_AE、CRF07BC、CRF08_BC、B亚型,多重巢式PCR法的灵敏度为91.7%,特异度达100%。结论多重巢式PCR法能准确鉴定广西CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型毒株,是_种简便、快速、低成本的亚型鉴定方法。
- 苏齐鉴周平闭志友肖信吴书志岑平邓伟邵一鸣梁浩
- 关键词:聚合酶链反应HIV-1基因型