安徽省自然科学基金(KJ2007B239)
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
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- 相关机构：安徽大学安徽建筑工业学院更多>>
- 发文基金：安徽省自然科学基金国家自然科学基金安徽省高等学校优秀青年人才基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- BP神经网络在蛋白质二级结构预测中的应用被引量：3
- 2009年
- 蛋白质结构预测是生物信息学研究的重要问题,而蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的关键步骤。文中通过BLAST工具得到Identity小于等于35%的46个蛋白质复合物的单链作为数据集,分别采用5位编码和Profile编码,通过不同大小的滑动窗口,对蛋白质二级结构进行预测。实验结果显示,富含"生物进化信息"的Profile编码有着明显的优势,各种精确度均得到了较好的结果,尤其是精确度QE明显高于5位编码的QE。
- 王菲露宋杰宋杨
- 关键词：蛋白质二级结构BP神经网络氨基酸序列
- 基于支持向量机的蛋白质相互作用位点预测
- 2008年
- 蛋白质的功能常体现在生物大分子的相互作用中,识别蛋白质相互作用位点对于研究蛋白质功能发挥着重要作用。蛋白质间主要通过表面残基发生相互作用,蛋白质相互作用形成复合体时,只有部分表面残基参与了该过程。基于序列谱信息,提取序列上相邻残基的序列谱作为输入特征向量,对大小为3和7的残基信息窗(win3,win7),分别采用支持向量机(SVM)分类器对蛋白质相互作用位点进行预测、比较和分析。最终实验结果为:win3的平均正确率为69.31%,win7的平均正确率为69.68%。
- 王菲露宋杰王池社杜秀全
- 关键词：蛋白质相互作用支持向量机
