国家教育部博士点基金(20020246019)
- 作品数:2 被引量:7H指数:2
- 相关作者:王洪海乐军刘丽蓉赖煦卉毕安定更多>>
- 相关机构:复旦大学更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金国家重点基础研究发展计划上海市科学技术委员会资助项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 基于生物信息学的结核杆菌候选药靶基因的分析筛选被引量:3
- 2004年
- 结核分支杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)是结核病的致病菌,MTB基因组和蛋白质组的研究为筛选新的抗MTB药物提供了可能.鉴于前人所做的工作,目前比较一致的意见是:与MTB细胞壁的合成相关的酶类,尤其是与脂肪酸合成和降解相关的酶类,是筛选抗结核杆菌药物的理想靶标.选取与脂肪酸合成、分解、转运相关的187个基因,分析blast结果,剔除与人和其他生物(如大肠杆菌等)蛋白序列相似性大于60%的基因.利用相关生物软件挑选出至少有一个糖基位点且具有溶剂可及性的抗原基因9个.本研究为以后分析药靶基因编码蛋白质的三维结构、利用现有的生物技术和有关的化合物对候选药靶进行功能研究、在细胞水平加以验证打下基础.
- 赖煦卉毕安定王洪海
- 关键词:药靶靶基因选药结核杆菌酶类
- 利用双向电泳技术研究异烟肼耐药MTB感染U937引致的差异表达蛋白被引量:4
- 2006年
- 利用双向电泳技术对结核分枝杆菌(MTB)异烟肼(INH)耐药株和敏感株感染人源巨噬细胞(U937)后的全细胞蛋白表达图谱进行差异比较和分析,发现其中产生差异的有86个蛋白质斑点.利用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱技术对其中8个差异表达蛋白质斑点进行分析鉴定,获得8个明确的肽质量指纹图谱.通过在蛋白质数据库中进行检索分析,确定这8个蛋白质中的2个为在INH耐药株感染的U937中差异表达的干细胞生长因子和主要组织相容性复合物Ⅰ类抗原,6个为在敏感株感染的U937中差异表达的微管蛋白4β、信号转导和转录激活子3、延长因子-2激酶、环指蛋白29、锌指蛋白193和SNARE Vti1a-β蛋白.实验结果显示,INH耐药株和敏感株感染后的U937表达蛋白有差异,这有助于分析解释临床中观察到的受INH耐药株感染的病例出现毒力下降、致病性下降、传染性降低以及潜伏期延长的现象.结果为针对INH耐药株进行的新疫苗的设计提供了探索方向.
- 刘丽蓉乐军王洪海
- 关键词:异烟肼耐药双向电泳