河南省教育厅科学技术研究重点项目(12B230015)
- 作品数：3 被引量：4H指数：2
- 相关作者：徐永杰梁小娟王志萌王延博郭英更多>>
- 相关机构：信阳师范学院华中农业大学更多>>
- 发文基金：河南省教育厅科学技术研究重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 猪hnRNPK基因启动子的克隆及序列分析
- 2014年
- 首次克隆了猪hnRNPK基因启动子序列,并进一步对该序列进行了分析.结果显示:该基因启动子约1 kb,与已报道的人的相应序列相似度为78.9%,具有相同的"TCTCGCGAGA"核心启动子序列和转录起始位点.利用在线软件分析发现,猪hnRNPK基因启动子不含TATA盒,而含有CAAT盒的GC富集区,存在两处CpG岛,具有SP1、UCE.2、GCF、EARLY-SEQ1、TTR_inverted_repeat、NGFI-C、EARLY-SEQ1等多种转录因子潜在结合位点,并且具有8种基序结构.
- 马超锋梁小娟王明玉徐永杰
- 关键词：启动子转录因子
- 猪CCT5基因的cDNA克隆、序列分析及时空表达被引量：2
- 2013年
- 基于2-DE和MS的蛋白质组学方法分析梅山猪骨骼肌发育过程中蛋白质动态表达变化,发现CCT5差异表达。为进一步获得猪CCT5基因的序列特征、时空表达及生物学功能等相关信息,克隆猪CCT5基因,分析不同物种序列进化关系,检测CCT5在猪不同组织和骨骼肌不同发育阶段中的表达。序列分析结果表明:在获得的2 286 bp猪CCT5 cDNA序列中包括1 626 bp的完整开放阅读框(ORF),编码541个氨基酸,其氨基酸序列与人的相似性为97%,表明该蛋白在不同物种间高度保守。荧光定量PCR结果显示,CCT5基因在猪肌肉和脂肪中表达量最高,心、肝等组织中表达量很低,没有肌纤维特异性;不同发育阶段骨骼肌中,该基因在出生后3 d的表达量最高,胚胎期表达量最低;在不同品种间,胚胎期及出生后3、30和180 d的表达量大白猪显著高于梅山猪(P<0.05),而60 d却显著低于梅山猪(P<0.05)。结果提示:CCT5基因在猪骨骼肌发育过程中起着重要作用。
- 徐永杰郭英王延博金芳芳刘邓英梁小娟宋新强陈世锋熊远著马云
- 关键词：骨骼肌克隆
- 猪14-3-3蛋白家族基因生物信息学分析被引量：2
- 2015年
- 14-3-3蛋白在哺乳动物中均有表达,是一类高度保守的酸性蛋白家族,广泛参与各种信号传导途径,具有十分重要的功能。本研究以猪的14-3-3蛋白家族为研究对象,运用生物信息学方法,首先对猪(Sus scrofa)14-3-3蛋白家族基因组数据库进行搜素,获得猪14-3-3蛋白家族的7个亚型。然后通过对所有的猪14-3-3蛋白家族的DNA序列及各种表达序列标签(Expression Sequence Tags,ESTs)作进一步比对分析。结果表明:猪14-3-3蛋白家族的7个亚型在猪中均有表达;蛋白质多序列匹配分析表明猪14-3-3蛋白存在多个保守结构域,在各功能区段相当保守;通过基因结构分析、ESTs表达分析和蛋白质预测分析表明,14-3-3蛋白质家族均为亲水性蛋白,且不同亚型在猪体内不同组织表达,参与不同的生物学功能。本文将为猪14-3-3蛋白家族进一步的功能分析提供研究基础。
- 梁小娟王志萌孟琼张凯丽徐永杰
- 关键词：基因家族进化分析基因结构
