中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(0032012024)
- 作品数：3 被引量：11H指数：2
- 相关作者：刘君璞朱迎春孙德玺邓云薛莹莹更多>>
- 相关机构：中国农业科学院郑州果树研究所河南农业大学北京市大兴区农业科学研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家现代农业产业技术体系建设项目国家西甜瓜产业技术体系建设专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 西瓜NBS类同源序列的克隆与分析(摘要)
- R基因产物是植物抵抗病原物侵害的重要组成部分,在目前已经发现的植物抗病基因中,NBSLRR类占了绝大多数,在植物抗病基因中占有重要地位。NBS结构域是NBS-LRR基因编码蛋白中最保守的部分,含有8个保守基序,包括P-l...
- 薛莹莹孙德玺邓云朱迎春刘君璞
- 关键词：西瓜NBS根结线虫
- 文献传递
- RGA法克隆NBS-LRR类抗病基因同源序列及其在葫芦科作物上应用的研究进展被引量：2
- 2014年
- RGA克隆法是利用抗病基因产物的保守结构域人工设计简并引物,以植物gDNA或cDNA为模板进行PCR扩增而克隆植物抗病基因同源序列的方法。随着各种植物基因组测序计划的完成及计算机和生物信息学的发展,植物抗病基因的克隆取得了很大进展,目前人们已经从植物中克隆得到100多个抗病基因。研究表明,大多数抗病基因都存在NBS-LRR、STK、LZ、TIR等功能保守的结构域,其中大部分都为NBS-LRR类型,利用NBS-LRR保守结构域设计PCR引物已经从植物中扩增出大量的RGA。简要综述了已克隆NBS-LRR类抗病基因的结构特点和功能、RGA法克隆NBS-LRR类抗病基因同源序列及其在葫芦科作物上应用的研究进展,并探讨其未来的发展与应用。
- 薛莹莹孙守如孙德玺邓云朱迎春刘君璞
- 关键词：RGANBS-LRR抗病基因甜瓜黄瓜
- 西瓜种质资源对南方根结线虫抗性鉴定被引量：9
- 2012年
- 【目的】为了研究准确鉴定评价西瓜种质资源抗南方根结线虫侵染能力的方法,筛选抗性材料,【方法】以35份西瓜种质资源为试材,采用盆栽幼苗人工接种方法,测定了南方根结线虫侵染60 d时西瓜幼苗各器官相对生长量及相关抗病指标,并进行了聚类分析和隶属函数分析。【结果】结果表明,南方根结线虫侵染后不同西瓜种质资源幼苗各器官的相对生长量、抗病指标及其变异系数的影响显著不同;采用变异系数最大的根结指数进行聚类分析结果与4个抗病指标综合分析结果存在微小差异,但与5个相对生长量指标以及相对茎鲜质量的聚类分析结果存在较大差异。根据综合指标隶属函数分析,确定了西瓜种质资源抗南方根结线虫的顺序。【结论】采用多指标综合聚类分析与单一指标聚类分析相结合更能准确划分西瓜种质资源抗根结线虫的类群,通过综合鉴定评价,可将供试的35份西瓜种质资源分为高感、感病、低抗3个类群,无中高抗材料,其中抗性最强的是红籽瓜,抗性最弱的是中科6号。
- 邓云王志伟孙德玺芦金生马双武朱迎春刘君璞
- 关键词：西瓜种质资源南方根结线虫抗性指标聚类分析
- 西瓜NBS类同源序列的克隆与分析(摘要)
- 2014年
- R基因产物是植物抵抗病原物侵害的重要组成部分,在目前已经发现的植物抗病基因中,NBSLRR类占了绝大多数,在植物抗病基因中占有重要地位。NBS结构域是NBS-LRR基因编码蛋白中最保守的部分,含有8个保守基序,包括P-loop(又称Kinase-1a)、Kinase-2a、Kinase-3a和GLPL疏水结构域等。对西瓜NBS的克隆和分析将有助于筛选西瓜抗病基因及各种抗病基因的分子标记,而且通过对西瓜NBS的结构、表达和调控的研究,将有助于深入阐释西瓜的抗病机制。以根结线虫抗病西瓜材料‘红籽瓜’和感病西瓜材料‘ZDPI0006’为试材,根据西瓜NBS保守区设计简并引物及特异引物50对,根据葫芦科抗病基因序列在西瓜基因组数据库搜索同源序列,并以此设计特异引物1对,分别提取西瓜叶片g DNA和RNA并反转录成c DNA,采用PCR扩增西瓜抗病基因同源序列,琼脂糖电泳检测回收目标条带,克隆测序后结果提交到Gene Bank进行序列比对,提交至Pfam在线分析蛋白质功能,利用Clustalx与其他物种的抗病基因进行同源性分析,利用dnasp等软件进行序列多态性分析。结果表明,49对引物中共有43对引物在抗、感材料中成功扩增到目的片段,其中有4对引物在抗感材料中扩增出差异片段,简并引物W856在抗、感材料间扩增到一条约750bp的差异片段,测序结果提交至NCBI比对显示其与预测的黄瓜抗TMV的N端类似蛋白存在88%的同源性,根据葫芦科抗病基因在西瓜基因组数据库搜索同源序列设计的特异引物W6580在抗、感材料间扩增出大小一致的约800bp的片段,测序结果提交至NCBI比对,结果显示其与预测的黄瓜抗线虫类似蛋白存在90%的同源性,dnasp软件分析显示抗、感材料之间存在4个单核苷酸多态性位点。
- 薛莹莹孙德玺邓云朱迎春刘君璞
- 关键词：西瓜NBS根结线虫
