国家自然科学基金(20275026) 作品数:13 被引量:89 H指数:5 相关作者: 李通化 陈开 高洪涛 毕贤 林淑芳 更多>> 相关机构: 同济大学 河南工业职业技术学院 济宁师范专科学校 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 理学 生物学 一般工业技术 金属学及工艺 更多>>
基于知识编码的剪切位点预测 被引量:3 2007年 在现有生物统计中,对脱氧核糖核酸中碱基的编码表达主要限于腺嘌呤,鸟嘌呤,胞嘧啶和胸腺嘧啶4种.但这种编码方式的变量太少,同时没有考虑碱基在脱氧核糖核酸中的位置信息,在剪切位点预测中,准确率不会超过90%.据此采用基于知识的编码方式,即真剪切位点与假剪切位点的统计差表,结合支持向量机方法,大大提高了剪切位点识别的准确率,并进一步采用碱基的统计特征的多变量编码方式使真给体位点和假给体位点的预报率分别达到96.4%和93.0%,真受体位点和假受体位点的预报率分别达到94.4%和93.0%. 黄金艳 李通化 陈开关键词:基因识别 支持向量机 编码方法 基于峭度的重叠峰解析新方法 被引量:12 2004年 峭度是表征曲线陡峭程度的物理量。本实验提出了基于峭度的组分分析 (componentanalysisbasedonkurtosis,CABK)方法来解析重叠峰 ,从中分离出纯组分信息。这种新方法的优点在于半盲源分离 ,即只要判断出重叠峰所含组分的数目 ,就可从混合谱中分离出各组分的纯谱信息。将它用来解析模拟两组分重叠峰体系和酒样的GC MS混合谱 。 高洪涛 李通化 陈开 毕贤 林淑芳关键词:峭度 非平衡态-恒电位配位滴定法同时测定铁和铝 被引量:16 2005年 以氟离子溶液作滴定剂,氟离子选择性电极作指示电极,在氟-铝反应没有达到平衡条件下通过恒电位配位滴定法同时测定了铁和铝。控制溶液的pH值为1.5,温度为25℃,硝酸钠离子强度调节剂浓度为0.1mol/L,反应时间为60 s。在氟-铁反应达到平衡,但在氟-铝反应没有达到平衡的条件下,采集滴定数据。根据非平衡条件下,响应值的重现性,利用最小二乘法求出常数kFe、kA l及k0,进而计算出铁和铝的浓度。 张云 孙健 于雪涛 李通化关键词:配位滴定 氟离子选择性电极 铁 铝 QSAR Studies on PCDD/Fs by Kernel PLS 被引量:1 2008年 QSPR models of PCDD/Fs were generated by means of kernel partial least squares. The molecular distance-edge vector method was used as descriptors to get model I for predicting PCDD/Fs retention behavior. The chlorinated positions were also used and model II was obtained. In studied cases, the predictive ability of the KPLS model is comparable or superior to those of PLS and ANN. The results indicate that KPLS can be used as an alternative powerful modeling tool for QSPR studies. TANG Kai-lin LI Tong-hua CHEN Kai关键词:PCDD/FS 非负矩阵因子法分析多元混合酸的pKa 2007年 提出了多元混合酸pKa的计算的新方法。主要原理基于混合酸体系滴定的数学模型,对于pKa相近的混合酸出现的重叠峰,首次把非负矩阵因子分析(Non-negative Matrix Factorization(NMF))法应用到滴定谱图解析,从而清楚识别出各种混合酸的pKa,总的平均相对误差小于3%,结果令人满意。 高军林 李通化 高洪涛 台明青关键词:混合酸 PKA NMF tPSODock:基于化学得分函数和两层粒子群算法的计算机分子对接程序 被引量:3 2005年 药物分子对接是计算机辅助药物设计的主要方法之一。利用化学得分函数(Chemscore)作为能量函数,以及将一种新的优化算法一两层粒子群算法作为搜索算法,得到了一种新的计算机分子对接程序:tPSODock。利用tPSODock计算了100个蛋白质-配体的复合物,并且与Consdock和Autodock 3.0计算结果进行了对比,结果显示88%的计算结果RMSD小于2.0A, 优于Consdock以及Autodock的计算结果。说明tPSODock在是一种高效的分子对接软件,可以用于大规模数据库的筛选工作,适合新药的开发和研制。 曹同成 陈开 李通化关键词:分子对接 粒子群算法 核方法在SELDI-TOF蛋白质组学数据分类中的应用(英文) 被引量:1 2007年 高解析质谱目前应用于疾病分类和治疗,然而海量数据的分析却遇到相当大的挑战。本文使用结合预处理的Kernel-PLS方法,可用于SELDI-TOF蛋白质组学数据分类。留一法交叉验证得到了敏感性0.9833和特异性1.0000的结果。 唐凯临 李通化 陈开 黄金艳独立组分分析在红外光谱分析中的应用 被引量:32 2004年 针对红外光谱的黑色体系分析 ,提出了一种基于独立组分分析 ( ICA)的红外光谱定性分析方法 .其主要优点在于可从混合光谱中分离出独立组分的光谱 ,且这种分离是盲源分离 ,混合物的组分预先是未知的 .对 ICA在正己醇、丙酮和正丁醇的混合中红外光谱分离中的应用进行了研究 ,验证了体系的独立性 ,并对ICA算法做了一定的改进 ,讨论了各种预处理方法对其分离结果的误差 . 毕贤 李通化 吴亮关键词:独立组分分析 ICA IR谱 基于正交投影校正的算法及其应用 被引量:5 2003年 基于正交投影的校正算法是近年来在光谱处理上显得较活跃的一种方法。本文介绍了基于正交投影的校正算法的基本原理,并对S.Wold、Fearn等人的比较成熟的5种基于正交投影的校正算法作了比较详细地介绍。最后对5种算法在谷物和柴油的近红外数据上的应用进行了比较和讨论。 毕贤 李通化关键词:正交投影 OSC 光谱分析 HMM用于G蛋白偶联受体超家族的识别 被引量:4 2004年 采用了一种HMM(隐马尔可夫模型 )的方法用于G蛋白偶联受体超家族层次各类别之间进行识别 ,具体考虑了ACDE与B类超家族 ,以及BCDE与A类超家族的分辨 ,取得了不错的效果 ,类之间的识别准确率可以达到10 0 % .研究过程中 ,考虑了G蛋白偶联受体一级结构信息和数据自身特性 ,合理地利用了G蛋白偶联受体一级结构序列的不等长特性 ,同时在模型的预测方面采用了双模型的预测机制 . 侯永丰 李通化关键词:G蛋白偶联受体 隐马尔可夫模型 信息系统