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国家自然科学基金(21190043)

作品数:3 被引量:2H指数:1
相关作者:张丽华张玉奎吴慈袁辉明周愿更多>>
相关机构:中国科学院中国科学院大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金全球变化研究国家重大科学研究计划国家重大科学仪器设备开发专项更多>>
相关领域:理学轻工技术与工程更多>>

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 2篇会议论文

领域

  • 3篇理学
  • 1篇生物学
  • 1篇轻工技术与工...

主题

  • 4篇蛋白
  • 4篇蛋白质
  • 4篇蛋白质组
  • 4篇蛋白质组学
  • 4篇白质
  • 3篇定量蛋白质组...
  • 2篇生物质谱
  • 2篇甲基化
  • 1篇色谱
  • 1篇色谱分离
  • 1篇水型
  • 1篇集成化
  • 1篇ORG
  • 1篇RAPID
  • 1篇MICROW...
  • 1篇C-
  • 1篇DIGEST...
  • 1篇AQUEOU...

机构

  • 4篇中国科学院
  • 1篇中国科学院大...

作者

  • 4篇张玉奎
  • 4篇张丽华
  • 3篇周愿
  • 2篇单亦初
  • 1篇张珅
  • 1篇梁玉
  • 1篇梁振
  • 1篇袁辉明
  • 1篇吴慈

传媒

  • 1篇色谱
  • 1篇Scienc...
  • 1篇轻工学报
  • 1篇中国化学会第...
  • 1篇中国化学会首...

年份

  • 1篇2016
  • 2篇2015
  • 2篇2014
3 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
基于质量亏损的准等重二甲基化标记蛋白质组定量方法
蛋白质参与生命活动的全部过程,并且体现生命活动过程的变化。研究蛋白质的表达量的变化对于发现具有重要生物功能的蛋白质、筛选与疾病相关的生物标志物以及寻找药物的靶标具有重要意义[1]。因此,蛋白质组样品的高准确度、精密度和宽...
周愿单亦初张丽华张玉奎
关键词:定量蛋白质组学生物质谱
文献传递
集成化蛋白质组定量分析平台的构建及应用被引量:1
2014年
为提高蛋白质组定量分析的准确度、通量和自动化程度,构建了由微升级混合离子交换色谱、亲水型固定化酶反应器(hIMER)和纳升级反相色谱-电喷雾串级质谱(nanoRPLC-ESI-MS/MS)组成的集成化蛋白质定量分析平台。该平台实现了二甲基化标记蛋白质样品在线分离、酶解、肽段分离鉴定和定量分析。采用质量比为1∶1的轻、重标记的蛋白质样品考察该平台的定量性能,发现蛋白质水平二甲基化标记效率为90%;蛋白质经hIMER在线酶解10 min产生的漏切及酶解产物在hIMER柱上的非特异性吸附对定量准确度的影响较小,所有定量到的重/轻标记的蛋白质质量比的平均值为1.01。最后将该平台应用于小鼠腹水型肝癌淋巴道高、低转移细胞系差异蛋白质的分析,发现了12种蛋白质在高转移细胞系中低表达,15种蛋白质在高转移细胞系中高表达。以上结果证明了该平台可以实现高准确度和高通量的蛋白质组定量分析。
周愿张珅袁辉明张丽华张玉奎
关键词:定量蛋白质组学
A rapid protein sample preparation method based on organic-aqueous microwave irradiation technique
2015年
Fast and efficient sample preparation methods are a prerequisite for protein identification in bottom-up proteomics. Here, an innovative microwave irradiation sample preparation method was developed based on an optimized organic-aqueous solvent system for protein identification. Specifically, protein solutions containing high-concentration acetonitrile were subjected to 5 min microwave irradiation. After cooling down, trypsin was added and the digestion was performed with 30 s microwave irradiation, and the resulting peptides were analyzed by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry(MALDI-TOF MS). A shortened processing time of only 5.5 min is needed with this method(more than 12 h is necessary in the traditional overnight protein sample preparation). Moreover, due to the absence of urea and other chaotropic reagents, the digests can be readily identified by MALDI-TOF MS. When an assessment of this method was performed by digesting a model protein BSA, 69% ± 3% sequence coverage corresponding to 47 ± 3 peptides was obtained, which shows better protein identification than that from the standard overnight protein sample preparation method(51% ± 2% sequence coverage and 23 ± 1 peptides). Another model protein α-casein was used for the analysis of protein phosphorylation with the newly developed method that yielded 4 phosphopeptides with 8 phosphorylation sites, whereas 3 phosphopeptides with 2 phosphorylation sites were obtained from the traditional overnight approach. Moreover, the organic-aqueous microwave irradiation method provides effective digestion for proteins down to fmol.
Shuaibin WuHongfei ZhangKaiguang YangJunfeng MaZhen LiangLihua ZhangYukui Zhang
关键词:DIGESTION
整体材料的研制及其在蛋白质组色谱分离中的应用被引量:1
2016年
整体材料由于具有制备简单、传质速度快、低背压、表面易于修饰等优势,在色谱分离领域中应用非常广泛.为使业界了解国内外对整体材料研制的现状,对有机聚合物整体材料、硅胶整体材料、有机-无机杂化整体材料三种整体材料的制备方法及其在蛋白质组学中蛋白质和肽段色谱分离中的应用进行了综述,指出:与填充柱相比,整体柱的分离柱效仍有待进一步提高,可以从整体材料的性能,如比表面积、孔径分布、稳定性、亲水性等方面进行改进.利用整体材料低背压的优势,可制备超长、超细内径毛细管整体柱,有利于微量蛋白质组学样品的高效分离分析.随着对整体材料制备技术的不断深入研究,整体材料也将在食品安全、生命科学、环境问题等众多领域发挥更重要的作用.
吴慈梁玉梁振张丽华张玉奎
关键词:色谱分离蛋白质组学
基于等重二甲基化标记的多重蛋白质组定量方法
稳定同位素标记结合质谱分析已经成为蛋白质组定量分析的主流方法。定量的依据可以分为基于一级谱峰面积和二级谱离子强度两类。前者虽可以实现多重样品的分析,但存在灵敏度低且一级谱图复杂度增加不利于蛋白质的定性等不足;基于二级谱离...
刘健慧周愿单亦初张丽华张玉奎
关键词:定量蛋白质组学生物质谱
文献传递
共1页<1>
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