国家自然科学基金(30901130)
- 作品数：2 被引量：10H指数：2
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- 台湾杉ISSR反应体系的建立及检测被引量：3
- 2011年
- 在保持1 UTaq酶和0.2 mmol/L dNTP两个条件不变的情况下,通过对模板DNA的浓度、引物浓度与Mg^2＋浓度的筛选,建立了台湾杉的优化ISSR反应体系,即在25μL的反应体系中,含有40 ng模板DNA、1 UTaq酶、0.2 mmol/L dNTP、0.4μmol/L引物、1.8 mmol/L Mg^2＋、2.5μL 10×buffer。扩增程序为：94℃,4 min;94℃,45 s,51-56℃,45 s,72℃,2 min,40个循环;72℃,7 min。利用这种优化的反应体系,筛选出了10条稳定性强、清晰度高并表现出一定多态性的ISSR引物,并进一步筛选出了这10条引物的最佳退火温度。应用这些引物对分布于湖北利川市星斗山保护区的台湾杉野生居群的20个样品进行了扩增,结果表明,利川星斗山台湾杉居群的多态位点百分率为61.97%,Nei’s基因多样性和Shannon’s信息指数分别为0.136 9和0.216 0。
- 杨琴军袁继林付强陈龙清
- 关键词：台湾杉ISSR引物筛选
- 台湾杉遗传多样性的ISSR分析被引量：8
- 2014年
- 采用ISSR分子标记技术,对台湾杉4个自然居群的遗传多样性水平和遗传结构进行研究。从100条引物中筛选出10条,得到78个清晰的扩增条带,其中多态性条带61个。POPGENE分析结果表明:台湾杉在物种水平(多态条带百分率PPB=78.21%,Nei’s基因多样性指数H=0.249 4,Shannon’s信息指数I=0.377 8)和居群水平(PPB=52.56%,H=0.178 3,I=0.267 7)均具有中等水平的遗传多样性。AMOVA分析表明,4个居群间出现一定程度的遗传分化,且遗传变异主要发生在居群内。UPGMA聚类和Mantel检测结果表明,居群间的地理距离与遗传距离之间不存在显著相关性(r=0.043 3,P=0.435 6)。根据台湾杉的遗传变异规律,提出有效的保护措施。
- 李江伟杨琴军刘秀群季华张卓文
- 关键词：台湾杉ISSR
