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国家自然科学基金(39800089)
国家自然科学基金(39800089)
- 作品数：2 被引量：37H指数：1
- 相关作者：张天真郭旺珍王凯韩志国更多>>
- 相关机构：南京农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 栽培四倍体棉种及其二倍体祖先种的Histone3基因片段序列分析被引量：1
- 2004年
- 组蛋白是植物基因组的重要组成部分。根据Genebank中登录的Histone3基因的全长cD NA序列,设计PCR引物,进行了异源四倍体栽培陆地棉、海岛棉及其二倍体祖先种非洲棉和雷蒙德氏棉中Histone3基因片段序列分析。不同物种中获得的基因片段分别由2个内含子、部分外显子区和3'端非翻译区组成。共存在77个单核苷酸多态性位点,其中外显子区9个,内含子Ⅰ区22个,内含子Ⅱ区21个,3'端非翻译区25个。外显子的SNP变化不影响Histone3基因的转录和翻译。分子聚类结果表明,不同物种A、D基因组的序列定向进化同源性明显,其中AvsD序列相似性为91.6%,AvsATB序列相似性为95.8%,AvsATH序列相似性为95.2%,DvsDTB序列相似性为98.5%,DvsDTH序列相似性为98.0%。A、D染色体组基因序列部分同源性分析表明,陆地棉中ATHvsDTH序列相似性为91.0%,海岛棉中ATBvsDTB序列相似性为92.5%。聚类结果再现了A、D基因组多倍体化后其基因序列与二倍体祖先种平行演化的特点以及A、D染色体组间进化速率在四倍体棉种中与二倍体祖先种中表现的一致性。本文也讨论了基因序列在不同物种中的相似性比较不仅是研究进化的有效方法,也可用于发现基因在不同物种中SNP序列及应用前景。
- 郭旺珍韩志国张天真
- 关键词：二倍体
- 利用SSR标记技术研究棉属A、D染色体组的进化被引量：36
- 2003年
- 利用SSR分子标记技术 ,对棉属A、D染色体组二倍体及四倍体代表棉种进行了遗传多样性分析。供试的10个二倍体代表棉种间遗传多态性丰富 ,分子聚类结果与Fryxell棉属分类结果相同。分子水平上进一步揭示出属于D染色体组的拟似棉与其他D染色体组棉种的相似系数最低 ,A、D染色体组间相似系数很高。该结果支持拟似棉是D染色体组最原始棉种 ,棉属不同染色体组是共同起源、单元进化的理论。利用栽培的异源四倍体棉种不太适于研究棉属A。
- 郭旺珍王凯张天真
- 关键词：SSR标记技术棉属D染色体组进化
