国家自然科学基金(30370641)
- 作品数：4 被引量：22H指数：2
- 相关作者：许丽艳李恩民蔡唯佳马云青牛永东更多>>
- 相关机构：汕头大学东北师范大学吉林市实验中学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 白桦酯醇对食管癌细胞EC109的抑制作用被引量：12
- 2006年
- 背景与目的白桦酯醇是一种重要的三萜类生物活性分子,本文从白桦树皮中提取获得白桦酯醇纯品,然后研究该生物活性分子抑制食管癌细胞的活性。材料与方法取一定量的白桦树皮干粉,通过乙醇回流,减压浓缩和甲醇-氯仿重结晶等步骤获得白桦酯醇纯品。用不同剂量的白桦酯醇作用于EC109食管癌细胞48h,噻唑蓝(Methylthiazoletetrazolium,MTT)法检测细胞抑制率。结果白桦酯醇作用于食管癌细胞EC109后,EC109细胞形态发生明显改变,细胞抑制率随白桦酯醇浓度的增高而增高,呈现剂量依赖关系。结论白桦酯醇对食管癌细胞EC109有明显抑制活性。
- 蔡唯佳马云青祁逸梅牛永东许丽艳李建新李恩民
- 关键词：白桦酯醇食管癌细胞抗肿瘤活性
- 新候选癌基因STRBP8在人永生化食管上皮细胞癌变过程中差异表达的分析被引量：7
- 2005年
- 背景与目的:近年来,核基质蛋白(nuclearmatrixproteins,NMPs)成分、结构与功能改变在肿瘤发生发展过程中的作用已成为人们研究的热点问题。分离并鉴定肿瘤相关的NMPs,是寻找肿瘤特异性标志物并进一步研究肿瘤发病机制的一个新途径。本研究通过检测类视网膜母细胞瘤结合蛋白8(similartoretinoblastomabindingprotein8,STRBP8)在人永生化食管上皮细胞癌变过程中的差异表达,为寻找食管癌特异性标志物和研究食管癌的发病机制提供新线索。方法:硫酸铵沉淀法提取人胚永生化食管上皮细胞系SHEE和由SHEE转化而来的食管癌细胞系SHEEC的NMPs,利用双向电泳、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI鄄TOF鄄MS)和RT鄄PCR等技术检测STRBP8在SHEE和SHEEC中的差异表达。将STRBP8cDNA序列连接到pGEM鄄Teasy载体后,转化TOP10F蒺大肠杆菌感受态细胞,经筛选获得含STRBP8的阳性克隆,DNA序列测定后进行BLAST比对。结果:通过双向电泳和MALDI鄄TOF鄄MS技术分离并鉴定出核基质蛋白STRBP8只在SHEEC中表达,RT鄄PCR分析发现STRBP8mRNA也只出现在SHEEC细胞中。将其cDNA序列插入pGEM鄄Teasy载体后,经转化和筛选获得含STRBP8的阳性克隆。测序结果显示克隆得到的STRBP8cDNA片段与Genbank数据库上的序列完全一致。结论:STRBP8作为一种新?
- 熊兴东李恩民许丽艳刘新光蔡唯佳韩雅莉沈忠英
- 关键词：食管肿瘤核基质蛋白双向电泳MALDI-TOF-MS
- NGAL基因新型TPA反应元件结合蛋白的研究被引量：2
- 2008年
- 以往研究发现, 食管癌细胞的中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(neutrophil gelatinase-associated lipocalin, NGAL)基因的过表达具有明显的 12-O- 十四烷酰佛波醇 -13- 醋酸酯(12-O-tetradecanoyl phorbol-13-acetate, TPA)诱导性, 在启动子- 152～- 60 区段存在着一种新型的 TPA 反应元件(TPA response element, TRE), 但是该元件的结合蛋白尚未被鉴定出来. 采用寡核苷酸 DNA 亲和层析法(oligonucleotide trapping)从食管癌细胞中分离纯化了 NGAL 基因 TRE 结合蛋白; 经 SDS-PAGE进一步分离, 银染显示目标蛋白带. 人工切取各目标蛋白带进行 MALDI-TOF-MS 分析, 通过 Mascot 软件搜索 NCBI 数据库, 根据蛋白质的功能、细胞定位和分子质量大小等指标确定 8 个核蛋白因子: C19、KIAA1949、TDRD1、RXR β、FAM54A、KLF15、KLF10 和 YY-1. 最后, 利用 RT-PCR 验证了这些核蛋白因子表达的 TPA 反应性, 结果表明 C19、KIAA1949、TDRD1、RXR β和 KLF15 等编码基因的转录表现出了明显的 TPA 反应性, 提示可能是食管癌细胞中应答 TPA刺激, 参与 NGAL 基因过表达的转录激活因子.
- 孟令英缪成贵杜则澎蔡唯佳许丽艳李恩民
- 关键词：NGAL基因MALDI-TOF-MS
- KEGG及其在顺式作用元件预测中的应用被引量：1
- 2003年
- 随着生物信息学的飞速发展,与之相应的各种类型的数据库不断涌现,KEGG数据库便是其中之一。本文详细介绍了KEGG数据库的主要内容及其功能,并以运用该数据库Mat Inspector V2.2软件预测NGAL基因5’端转录调控区增强于元件为例说明了KEGG数据库在基因转录调控研究中的应用。
- 王子良许丽艳李恩民
- 关键词：生物信息学
