国家自然科学基金(30871548)
- 作品数：7 被引量：48H指数：5
- 相关作者：刘爱忠徐荣华刘小烛邱丽俊阳天泉更多>>
- 相关机构：中国科学院西南林业大学中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院重点实验室基金中国科学院“百人计划”更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 小桐子EST-SSR分子标记的开发与种质遗传多样性分析被引量：8
- 2011年
- 小桐子(Jatropha curcas)适应性强,不择土壤,种子油脂性能适宜生物柴油的生产,是重要的生物柴油植物。基于小桐子种子发育过程中的EST序列,采用生物信息学方法,从4640个EST非冗余序列上鉴别了1009个SSR位点并分析其分布特征;开发了11对多态的EST-SSR分子标记,并利用这些分子标记调查了24个不同地理种源的遗传多样性,从每个位点的等位基因数目(2～3,平均为2.45)、期望杂合度(He为0.0887～0.5128,平均是0.2736)、多态信息含量(PIC为0.0847～0.4031,平均是0.2313)等方面反映了小桐子种质的遗传多样性低。进一步分析显示不同地理种源的遗传关系缺乏明显的地理结构。作者开发的EST-SSR分子标记不仅有助于小桐子种质的遗传多样性研究,也有助于小桐子种质间的遗传关系鉴别。
- 杨春刘爱忠
- 关键词：小桐子
- 蓖麻GPAT基因SNPs及与油脂含量的关联分析被引量：1
- 2012年
- GPAT基因对蓖麻储存油脂(triacylglycerols,TAG)的合成调控具有重要作用。为了从分子进化角度研究蓖麻GPAT的多态性,参考GenBank中编码蓖麻GPAT的基因组序列设计一对特异性引物对来自32个不同地区种质的GPAT进行测序,获得32个长约741bp的基因组序列。多态分析表明:在741bp的区间内共发现1个SNP,频率为1/741bp,多样性指数Pi为0.00069。结果表明GPAT基因与种质油含量和种子大小的关系均无明显相关性。该研究分析了GPAT基因的遗传多样性,遗传变异与油脂数量和种子大小性状的相关性。
- 徐宸敏邱旭刘小烛
- 关键词：蓖麻单核苷酸多态性
- 小桐子甘油-3-磷酸酰基转移酶(JcGPAT)cDNA的克隆与序列分析被引量：12
- 2011年
- 甘油-3-磷酸酰基转移酶是植物生物合成储存油脂过程中的关键酶,对油料作物种子含油量具有重要的限制作用。本研究以植物甘油-3-磷酸酰基转移酶同源基因的保守区域序列为基础,设计简并引物,结合RACE技术,从能源植物小桐子种子中克隆获得JcGPAT基因的cDNA全长序列(GenBank登录号HQ395225)。JcGPAT cDNA核苷酸序列长度为1672bp,开放阅读框为1125bp,编码375个氨基酸。该基因具有明显的GPAT基因结构域,其编码的氨基酸序列与油桐、蓖麻等植物具有很高的同源性。RT-PCR表达分析表明,该基因在小桐子发育的种子、叶、根尖等多个组织表达。
- 张楠徐荣华刘小烛刘爱忠
- 关键词：小桐子基因克隆
- 我国优势油脂类生物柴油植物蓖麻的种质资源发掘和生物柴油利用被引量：12
- 2014年
- 发展可再生生物质能源是解决人类能源危机和环境污染的重要途径。利用边际土地发展油脂类生物质能是生物质能的重要组成部分。蓖麻因为适应性强和油脂成份独特被誉为"理想的生物柴油植物"。蓖麻是我国优势油脂类能源植物,利用边际土地,发展蓖麻产业为我国生物柴油产业化提供原料,是我国现阶段生物柴油产业化发展的相对理想而又现实的选择,而且具有重要的发展前景和巨大的发掘潜力。立足我国现阶段生物柴油产业化的瓶颈问题,着重阐述了蓖麻种质资源发掘的现状、优良品种培育的途径和发展前景,以及利用蓖麻种子油生产商业化生物柴油的现状,以期推动我国利用边际土地发展蓖麻产业以及生物柴油商业化生产。
- 邱丽俊刘爱忠
- 关键词：生物质能源生物柴油
- 小桐子磷脂二酰甘油酰基转移酶(JcPDAT1) cDNA的克隆与功能鉴定被引量：9
- 2013年
- 使用简并PCR结合RACE技术从能源植物小桐子种子中克隆了一个PDAT基因的cDNA全长,命名为JcPDAT1(GenBank登陆号为HQ827796)。JcPDAT1全长2 869bp,包含一个长为2 013bp的开放阅读框,编码670个氨基酸。多序列比对和进化分析表明该基因编码蛋白与其他植物PDAT高度同源,具有典型的PDAT结构域。Realtime PCR结果表明JcPDAT1在种子、叶和根里面都有表达,且在种子发育过程中大量表达。酵母互补实验证实该基因编码蛋白具有PDAT酶活性。在与酿酒酵母突变体H1246α的互补实验中发现,TLC层析(薄层层析法)和尼罗红染色结果都显示JcPDAT1的表达使H1246α恢复合成TAG,说明JcPDAT1具有PDAT的功能活性。
- 徐荣华邱丽俊阳天泉王如玲田波刘爱忠
- 关键词：小桐子简并PCR基因克隆荧光定量PCR
- 蓖麻LPAAT基因序列的SNPs及与油脂的相关性被引量：1
- 2012年
- LPAAT对蓖麻储存油脂(triacylglycerols,TAG)的合成调控具有重要作用。为了研究蓖麻LPAAT的多态性,参考GenBank中编码蓖麻LPAAT的基因组序列设计引物,对来自32个不同地区蓖麻种质的LPAAT进行测序,获得长约804 bp的基因组序列。多态分析表明:在804 bp的区间内共发现2个SNP和3个InDel,SNP频率为1/161 bp,多样性指数Pi为0.000 67。在外显子区域,有1个SNP和2个InDel,其中2个为同义突变,1个为错意突变。结果表明,基因LPAAT的exon10与种子油脂含量有明显相关性。
- 徐宸敏刘小烛刘爱忠
- 关键词：蓖麻单核苷酸多态性油脂
- 烟草二脂酰甘油酰基转移酶基因(NtDGAT2)的克隆与功能分析被引量：7
- 2013年
- 二脂酰甘油酰基转移酶(diacylglycerol acyltransferase,DGAT2)是植物储存油脂生物合成过程中的关键酶,对种子储存油脂累积具有重要的生理作用。本文采用电子克隆与实验相结合的方法,从烟草种子cDNA中克隆到DGAT2基因的开放阅读框序列,命名为NtDGAT2(GenBank登录号JX843807),其序列长999bp,编码332个氨基酸。多序列比对和进化分析表明该基因编码蛋白与其他植物DGAT2具有较高相似性和典型的DGAT2结构域。利用Real-time PCR定量表达分析显示Nt-DGAT2在烟草种子、花、茎、叶和根里面都有表达,且在发育中的种子和花的发育过程大量表达。酵母互补实验证实该基因编码蛋白具有DGAT酶活性。
- 阳天泉徐荣华刘爱忠
- 关键词：烟草酵母油脂
