国家自然科学基金(31060125)
- 作品数：4 被引量：9H指数：2
- 相关作者：黄日波杜丽琴吴倩倩韦宇拓陈燕更多>>
- 相关机构：广西大学广西科学院学研究院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广西科学院基本科研业务费资助项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)外切葡聚糖酶CelB基因的发掘及功能鉴定被引量：5
- 2013年
- 从地衣芽孢杆菌的基因组数据中寻找与外切葡聚糖酶相似性高的DNA序列,发现在地衣芽孢杆菌基因组中CelB DNA片段具有很高的序列相似性。在大肠杆菌中对来自地衣芽孢杆菌的CelB基因DNA片段进行表达并纯化蛋白质。CelB蛋白质对纤维素底物具有活性。根据糖基水解酶家族48的保守活性位点设计突变策略对CelB进行突变,突变体丧失对底物的活性,说明它具有糖基水解酶家族48的外切葡聚糖酶的典型活性位点。
- 庞浩陈燕吴倩倩刘春宇郭媛林丽华黄日波
- 关键词：基因组信息学地衣芽孢杆菌蛋白质结构定点突变
- 产左聚糖枯草芽孢杆菌的突变选育及多糖产物的生物物理分析被引量：1
- 2012年
- 本研究对多糖产生菌株sp.54A-42进行了16SrDNA序列比对分析,鉴定其为枯草芽孢杆菌。对发酵所得多糖产物进行了薄层层析、高效液相色谱、红外光谱和核磁共振分析,证明发酵产物为左聚糖(β-2,6-果聚糖)。通过紫外-LiCl复合诱变方式选育,得到突变株sp.Z-49,多糖产量达到16.1g/L,比出发菌株提高了34.2%,经5次传代发酵实验产量稳定,为进一步研究左聚糖的发酵生产打下了良好基础。
- 杨辉李杰民余磊赖祯冬杜丽琴韦宇拓黄日波
- 关键词：枯草芽孢杆菌
- 一种蛋白质三维结构中残基重心的计算方法
- 2013年
- 基于蛋白质三维结构数据PDB,给出一种蛋白质残基重心的计算方法,同时阐述该方法的python语言的实现过程.该方法不需要知道残基侧链原子的坐标,只需知道主链上原子的坐标即可计算蛋白质残基间的距离.
- 陆文伟韦廷宗李涛杜丽琴黄日波
- 关键词：PDB球坐标PYTHON语言
- 阴沟肠杆菌GX-3的中性蔗糖酶在大肠杆菌中的表达及其特性鉴定被引量：3
- 2015年
- 【目的】在阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)GX-3中发现了一个编码中性p H范围内起作用的蔗糖酶基因,在大肠杆菌(Escherichia coli)中进行克隆表达及纯化,并研究该蔗糖酶的酶学性质,为蔗糖酶的应用研究及开发利用奠定基础。【方法】通过查找Gen Bank数据库中来自阴沟肠杆菌同属中的编码蔗糖酶的基因序列,对这些序列进行比对分析设计简并引物扩增保守区;利用PCR扩增目的基因,以p QE30为表达载体构建重组质粒;镍亲和层析纯化重组蛋白,对重组酶的酶学性质进行详细研究。【结果】一个编码蔗糖酶的基因(Einv)被从阴沟肠杆菌GX-3中发现和克隆。生物化学特性鉴定表明这个蔗糖酶的活性最适温度为40℃和最适p H为6.5。凝胶渗透色谱法分析显示Einv是以二聚体的形式存在。Einv这个蔗糖酶在1170 mmol/L的蔗糖条件下仍保留有80%以上的水解活性。而在高浓度的蔗糖条件下,Einv只有水解活性而没有转糖基的副反应发生。它能够水解棉子糖、蔗果三糖、蔗果四糖、蔗果五糖和水苏糖。【结论】获得的Einv是一个在中性p H范围内起作用的β-呋喃果糖苷酶,只有水解功能而没有转糖基功能。这些特性表明这个中性蔗糖酶在食品工业具有重要的应用价值。
- 赵英丽吴倩倩张志凯王子龙韦宇拓黄日波杜丽琴
- 关键词：Β-呋喃果糖苷酶蔗糖酶生物化学性质
