国家质检总局科技计划项目(2004IK-029)
- 作品数:2 被引量:28H指数:2
- 相关作者:伍永明张祥林罗明王翀李碧佳更多>>
- 相关机构:新疆出入境检验检疫局新疆农业大学更多>>
- 发文基金:国家质检总局科技计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 西瓜细菌性果斑病菌Taq Man探针实时荧光PCR检测鉴定方法的建立被引量:18
- 2006年
- 根据西瓜细菌性果斑病菌(Acidovorax avenaesubsp.citrulli)与相关细菌16S rDNA序列差异,设计出对西瓜细菌性果斑病菌具有稳定点突变特异性探针Aac-probe,利用该探针对23种供试菌株进行了实时荧光PCR检测实验。结果表明,只有西瓜细菌性果斑病菌能检测到荧光增强信号,其它细菌无荧光增强信号。该方法特异性强,灵敏度高,重复性好,可有效地应用于西瓜细菌性果斑病菌的检测。
- 伍永明张祥林罗明
- 关键词:TAQ实时荧光PCR西瓜细菌性果斑病菌RDNA
- 西瓜细菌性果斑病菌的16S rDNA序列分析及特异性引物的设计被引量:10
- 2007年
- 利用细菌16S rDNA基因的通用引物对16个供试菌株进行PCR扩增,把扩增产物进行核苷酸序列测定。将获得的序列与GenBank中相关菌株的16S rDNA序列进行同源性分析。以此设计出检测A.a.c的特异性引物,并利用最大简约法构建了16S rDNA系统演化树。系统演化关系分析表明,6~9号供试菌株的16S rDNA序列与A.a.c标准菌株仅有3个位点的差异,其同源性均在99.8%以上,在构建的系统演化树上,它们聚为同一个族群。利用设计的一对特异性引物(BFB64/65),对各供试菌株进行PCR检测,结果只有A.a.c相关菌株产生扩增条带,产物大小与预期一致。
- 张祥林伍永明王翀李碧佳
- 关键词:RDNA系统发育引物设计