曹开源
所属机构: 中山大学 所在地区: 广东省 广州市 研究方向: 医药卫生 发文基金: 广东省自然科学基金
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徐霖 作品数:80 被引量:241 H指数:8 供职机构:中山大学中山医学院 研究主题:前列腺癌 流行病学调查 人冠状病毒 引物 流行病学 袁广卿 作品数:58 被引量:259 H指数:8 供职机构:中山大学 研究主题:实验教学 分子医学 前列腺特异膜抗原 肠道病毒 生物安全实验室 张甜 作品数:25 被引量:100 H指数:5 供职机构:中山大学中山医学院临床检验标准化研究中心 研究主题:前列腺癌 铜绿假单胞菌 流行病学特征 流行病学调查 人冠状病毒 张定梅 作品数:40 被引量:178 H指数:8 供职机构:中山大学公共卫生学院 研究主题:引物 分子进化 探针 流行病学特征 禽流感 何霞 作品数:21 被引量:48 H指数:4 供职机构:中山大学 研究主题:人博卡病毒 病毒分离株 甲型H1N1流感 末端转移酶 端粒
2009年广州人肠道病毒EV71型分离株重组分析 被引量:2 2013年 对人肠道病毒EV71型2009年广州分离株Guangzhou09构建序列系统进化树并分析其重组特点。P1、P2和P3区种系发生进化树提示该分离株发生重组,相似性曲线以及bootscan进一步分析显示该分离株于非结构编码蛋白2B片段区(核苷酸位置4 027bp)处存在EV71亚型C4Shanghai-FJ713137与CVA409-HQ728260型间重组。该分离株与中国大陆目前优势株流行趋势一致,是广州首例发生型间重组且由C4亚型及CVA4型发生重组。 关琳琳 汪杨 罗燕芬 徐霖 张定梅 曹开源关键词:手足口病 高通量测序筛选结核分枝杆菌耐药株差异基因 被引量:3 2014年 目的比较结核分枝杆菌中敏感株、多耐药株、广泛耐药株三者间基因表达的差异,为进一步针对耐药菌株的研究提供方向。方法从深圳市第三人民医院收集敏感株、多耐药株、广泛耐药株各1株,提取菌株RNA,然后构建cDNA文库,使用Genome Analyzer IIx高通量测序仪进行全基因组测序,经过筛选比对后得到测序结果 ,再比较3个菌株间的基因表达差异。结果高通量测序后共得到基因3 968个。将耐药株与敏感株的基因进行比较,选取表达差异高于10倍的基因,筛选得到多耐药株差异基因16个、广泛耐药株差异基因10个。这些表达差异基因大部分与毒素-抗毒素系统、PE/PPE家族蛋白、金属转运蛋白相关。还在多耐药株中发现了一系列高表达的前噬菌体基因及噬菌体整合相关的基因。结论通过高通量测序筛选得到一系列耐药株差异表达基因,为未来对耐药菌株的研究提供依据。 李劭源 张国良 文玉欣 毛冬婷 曹开源 陈心春 曾谷城关键词:结核分枝杆菌 耐药株 高通量测序 胸苷激酶基因系统对膀胱癌细胞及凋亡基因的影响 被引量:3 2005年 目的 探讨单纯疱疹病毒胸苷激酶 /丙氧鸟苷 (HSV TK/GCV )系统对膀胱癌细胞BIU 87的杀伤作用及对凋亡基因的影响。方法 脂质体将TK基因成功转入BIU 87,噻唑蓝(MTT)法、TUNEL法、流式细胞仪 (FCM )分别检测GCV对其生长影响及凋亡率和细胞周期变化 ;逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)检测bcl 2、bax、bak、Caspase 3mRNA表达变化 ,比色法测定Cas pase 3活性变化。结果 作用 5d 1mg/LGCV能杀死 67%的细胞 ,10 0mg/LGCV达到最大杀伤率杀死 97%的细胞 ;GCV诱导细胞凋亡 ,细胞周期阻滞在S和G2期 ;bcl 2表达降低 ,bax表达升高 ,Caspase 3表达及活性升高。结论 HSV TK/GCV系统可有效杀伤膀胱癌细胞并引起细胞凋亡 ,细胞周期阻滞、bcl 2和bax表达变化、Caspase 3活化是引起凋亡发生的重要因素。 毛晓鹏 丘少鹏 曹开源 袁广卿 陈显景 徐林关键词:膀胱癌细胞 GCV 凋亡基因 BAX表达 胸苷激酶基因 逆转录一聚合酶链反应 2011-2013年广州地区腹泻病毒的病原学研究 被引量:14 2015年 目的调查2011-2013年广州地区7种主要腹泻病毒的流行状况和特点。方法收集2011-2013年广州地区腹泻患者粪便标本1 587份,采用ELISA检测粪便标本中A组轮状病毒抗原,用荧光定量RT-PCR的方法对采集的粪便标本进行6种病毒核酸检测,结合病人的临床资料进行病原学特征分析。结果 1 587份粪便标本中571例检出为腹泻病毒阳性,检出率为35.98%,主要腹泻病毒的检出率分别为:A组轮状病毒18.15%(288/1 587)、诺如病毒12.10%(192/1 587)、腺病毒6.87%(109/1 587)、星状病毒1.83%(29/1 587)、札如病毒0.69%(11/1 587)、B组轮状病毒0.25%和C组0.19%;腹泻病毒在1~岁婴幼儿和75~93岁老人腹泻病毒的总检出率最高,分别为57.57%和51.65%,在7~15岁少年检出率降到最低24.36%;〈3岁婴幼儿、3~74岁人群、75~93岁老人组检出率分别为43.62%、30.66%、51.56%,差异有统计学意义(P〈0.05);男女检出率差异无统计学意义(P〉0.05);腹泻病毒全年均可检出,夏季以诺如病毒感染为主而秋冬季以A组轮状病毒感染为主。结论 2011-2013年间广州地区腹泻病毒发病率较高,全年均有检出;发病率无性别差异;流行高峰出现在3月份;3岁以下幼儿和75岁以上老人是腹泻病毒监测的重点人群。 洪展桐 徐霖 钟慧玲 张素粉 罗虹娇 庹玖玲 张甜 曹开源关键词:腹泻病毒 病毒性腹泻 病原学 乳腺癌干细胞富集及其特异性多肽的筛选 被引量:1 2013年 目的:无血清培养法富集乳腺癌干细胞(breast cancer stem cell,BCSC)并采用噬菌体展示技术,筛选能特异性结合乳腺癌干细胞的噬菌体多肽。方法:无血清培养法富集乳腺癌MDA-MB-231细胞株中干细胞并以此为靶标,以hs578bst人正常乳腺细胞及普通培养的MDA-MB-231细胞为减性筛选细胞,对噬菌体随机肽库进行双重减性筛选,选取富集后的阳性噬菌体单克隆,ELISA及DAB染色鉴定阳性噬菌体特异性并测序。结果:经过3轮筛选,噬菌体得到约500倍的富集,随机挑选10株单克隆噬菌体。ELISA显示,6号噬菌体单克隆对乳腺癌干细胞的亲和力是对照的6.14倍;DAB鉴定亦显示,其对乳腺癌干细胞的特异性及亲和力最高,对阳性噬菌体DNA测序翻译得到十二肽氨基酸为GYSASRSTIPGK。结论:通过干细胞富集及噬菌体展示技术,成功筛选出能够特异性结合乳腺癌干细胞的特异性噬菌体多肽,为乳腺癌的干细胞靶向治疗和深入研究奠定基础。 孔冕 戴淑琴 李宝江 王军业 林雨 臧林泉 曹开源关键词:乳腺肿瘤 肿瘤干细胞 噬菌体展示 2011-2013年广州地区发热呼吸道感染患者的人流感病毒监测及其亚型的流行特征分析 被引量:8 2015年 目的了解2011-2013年广州地区发热呼吸道症候群患者的人流感病毒及其亚型流行特征。方法收集广州市2011-2013年5家哨点医院共2 085例发热同时伴随有呼吸道感染症状病人的咽拭子标本及相关临床信息,对人流感病毒进行筛查,并结合临床信息,分析其流行特征。结果 2011-2013年收集到的2 085份样本中237例经普通PCR检测为人流感病毒阳性,检出率为11.4%,其中人流感病毒甲型和乙型阳性的标本分别为202例和35例(阳性率分别为9.68%和1.68%),以甲型流感为主;人流感病毒阳性率最高组别为学生(大中小学生)组,就诊率最高科室为儿科;男女比例1.34:1,性别发病率差异无统计学意义;亚型流行高峰呈不均匀分布,其中流感病毒甲型发病高峰为3-5月;流感病毒乙型分布较为分散;广州地区人流感病毒是以0~岁组、7~岁组及18~39岁年龄组易感,各年龄组发病率差异有统计学意义;广州地区甲型流感病毒也是以18~39岁组高发,各年龄组发病率差异无统计学意义;乙型感染则以7~17岁组发病率最高。结论 2011-2013年广州并未暴发大型的人流感病毒疫情,人流感病毒以甲型流感为主,乙型流感也有散发,未发现丙型流感病毒感染;流行高峰出现在3-5月,18~39岁年龄组发病率最高。 陈敏静 徐霖 钟慧玲 张素粉 罗虹娇 庹玖玲 张甜 曹开源关键词:呼吸道感染 流行病学调查 甲型流感病毒的研究进展 被引量:21 2015年 流感病毒是有包膜的单股负链RNA病毒,属于正粘病毒科,包括人流感病毒和动物流感病毒。根据核衣壳蛋白(NP)和基质蛋白(MP)不同,人流感病毒分为甲(A)、乙(B)、丙(C)三型,是流行性感冒(流感)的病原体。2009年3月,甲型H1N1流感爆发,由于其为新的流感病毒株,人群对其缺乏免疫力,导致其在全球范围内迅速蔓延。据WHO统计,截至2010年3月19日,这种新病毒已经波及213个国家,共造成16 813例死亡。本文主要从流感病毒的结构、功能、变异和耐药作一综述。 许沙沙 田鹏 曹开源关键词:甲型流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 生物活性有机锌佐治慢性前列腺炎223例 被引量:1 2004年 目的 观察生物活性有机锌辅助治疗慢性前列腺炎的临床疗效。方法 应用补充含生物活性有机锌的活性蛋白制剂 (锌硒宝 )治疗 2 2 3例慢性前列腺炎患者 ,测定治疗前后患者前列腺液中锌离子浓度 ,并观察治疗前后患者的前列腺炎症状评分以及最大尿道闭合压的变化。结果 治疗后 ,前列腺液中锌离子浓度明显提高 ,前列腺炎症状评分和最大尿道闭合压则明显下降 ,其下降幅度均显著大于未补充生物活性有机锌的对照组 (P均 <0 0 5 )。结论 补充生物活性有机锌可提高慢性前列腺炎患者前列腺液中的锌离子浓度 ,有助于患者临床症状的缓解 ,提高其生活质量 ,是慢性前列腺炎有效的辅助治疗方法之一。 曾永光 冯建华 曹开源关键词:慢性前列腺炎 药物治疗 锌硒宝 抗前列腺特异性膜抗原膜外区多肽单克隆抗体的研制及初步应用 被引量:1 2008年 目的建立前列腺特异性膜抗原(PSMA)膜外区多肽杂交瘤细胞株,并对其分泌的PSMA单克隆抗体进行初步鉴定,为PSMA的功能研究和人源化抗体的制备奠定基础,以求进一步用于前列腺癌的诊断和治疗。方法使用人工合成多肽免疫BABL/c小鼠,采用PEG融合技术建立杂交瘤细胞株,制备单克隆抗体。通过免疫荧光法、酶联免疫吸附法及斑点金标法确定单克隆抗体的交叉反应性、亲和力及免疫球蛋白的类型和亚类。结果获得两株可稳定分泌PSMA单克隆抗体的杂交瘤细胞,4F4为IgG1类,1F1为IgG3类。两株单抗均能识别LNCap细胞表达的PSMA蛋白,与不表达PSMA的PC-3、SP2/0等细胞无交叉反应。杂交瘤细胞株1F1培养上清效价为1∶40,腹水效价为1∶6400;而杂交瘤细胞株4F4培养上清效价为1∶80,腹水效价为1∶8000。结论成功地制备出两株抗PSMA单克隆抗体,均具有良好的特异性和亲和力,为进一步建立免疫分析方法,进行PSMA相关研究奠定了基础。 曹开源 杨羚 徐霖 袁广卿 张甜 丘少鹏 沈关心关键词:多肽 单克隆抗体 RNAi沉默G250/MN/CAIX基因对肾癌Ketr-3细胞株生物学行为的影响 2009年 目的观察RNAi沉默G250基因表达后,肾癌Ketr-3细胞生长速度和体外侵袭力的变化。方法据G250基因的序列合成shRNA并克隆至真核表达载体pSilencer2.1-U6-neo中,构建G250shRNA真核表达载体,将该载体转染至人肾癌Ketr-3细胞株中。采用RT-PCR、West-ernblot及间接免疫荧光法对干扰效率进行检测。MTT法观察干扰后细胞生长情况的变化,Tran-swell小室体外侵袭实验探讨干扰后细胞体外侵袭能力的变化。结果成功构建了G250shRNA的真核表达载体。RT-PCR、Western blot和间接免疫荧光检测表明转染G250shRNA真核载体的肿瘤细胞G250/β-actin的比值明显降低。细胞生长曲线结果显示Ketr-3-MNRi组与Ketr-3组和阴性对照组Ketr-3-NC相比较,肿瘤细胞生长减慢;Ketr-3-MNRi细胞其穿膜细胞数明显低于Ketr-3-NC及Ketr-3细胞。结论G250shRNA可以下调ketr-3细胞G250的过度表达,抑制肿瘤细胞生长,下调其侵袭能力,为探讨G250在肾癌的发病机制中的作用及生物学治疗肾癌提供实验基础和理论依据。 李乐军 刘辉 吴荣佩 曹开源 李晓飞关键词:肾肿瘤 RNA干扰