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普氏野马GH基因的克隆及生物信息学分析
2023年
普氏野马(Equus przewalskii)属国家Ⅰ级保护动物,是现存的马中唯一的野生亚种。生长激素(Growth Hormone,GH)是大脑垂体前叶分泌的一种多肽类激素,对动物个体的生长、发育的影响极其明显。为了更好的保护普氏野马,提高其野外生存与繁殖能力,本研究利用PCR技术首次获得了普氏野马GH基因,并利用生物信息学方法对其编码的蛋白质结构和功能进行分析和预测,旨在探明普氏野马生长激素(Growth Hormone,GH)基因的结构特点以及其编码蛋白质的结构与功能。结果显示,普氏野马GH基因所在基因组DNA全长为1577 bp,经BLAST比对后,发现普氏野马与家马(GenBank:EU939446.1)GH基因序列相似性高达99.68%,属于同源序列。该基因编码蛋白质的氨基酸数量为152个,分子量为17638.54 Da,理论等电点为9.01,带负电荷的残基总数(Asp+Glu)为19个,正电荷残基总数(Arg+Lys)为23个,分子式为C790H1274N216O226S7。普氏野马GH蛋白属于细胞外蛋白,含有生长激素样结构域,不具有相关跨膜结构,其含有信号肽的可能性为0.35%。这为普氏野马GH基因的开发利用奠定了分子基础。
郭雅男刘霞郑丽平王海芳
关键词:普氏野马GH基因基因克隆生物信息学
GH基因SNPs与宁都黄鸡睾丸性状的关联分析
2023年
为探索生长激素基因(Growth hormone,GH)部分序列单核苷酸多态位点及其单倍型对宁都黄公鸡睾丸性状的影响,寻找地方鸡种睾丸性状选育的分子标记,试验选取499只16周龄宁都黄公鸡为研究材料,采用PCR直接测序法筛选GH基因5′-flanking和内含子1区域的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点,利用SAS(Statistical analysis system)分析睾丸性状关联的SNP位点,利用PHASE软件对多态位点进行单倍型分析,并使用在线软件对关联位点的转录因子结合类型进行预测。结果显示:GH基因上游序列存在6个多态性位点,即T1272755C、G1272611A、C1272225T、C1271211T、C1271025A和A1271024C,均对睾丸性状的影响达到显著水平(P<0.05);与睾丸性状相关的优势基因组合为TGCCAC/TGCTAC;转录因子预测结果显示在一些转录因子的结合位点会随着等位基因变异而发生特异性变化,如AR(Androgen receptor)、PR(Progesterone receptor)、Sox2(sex determining region Y-box 2)、SRY(Sex determining region Y)、HNF-3beta(Hepatocyte nuclear factor 3-beta)等。研究表明C1271211T为宁都黄鸡睾丸性状的关键候选分子标记,CC基因型个体的睾丸性状显著高于TT型,推测原因为上述5种转录因子之间相互作用,调控GH表达,共同影响睾丸性状。
马荆鄂许继国姚利君谭玉文朱学农杨艳北饶友生周敏
关键词:宁都黄鸡生长激素基因
宁都黄鸡GH基因SNP与鸡冠性状的关联分析被引量:1
2023年
【目的】研究宁都黄鸡GH基因(Growth hormone,GH)5’-侧翼和内含子1区域单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)与鸡冠性状的关联性,以期筛选地方鸡种鸡冠性状的早期选育分子标记。【方法】以499只宁都黄鸡公鸡为研究对象,测定7个不同周龄的冠高、冠长、冠厚、肉垂长、肉垂厚以及冠齿数指标,利用SAS(Statistical analysis system)分析GH基因部分序列SNP与鸡冠性状的关联性。【结果】有13个SNP与冠高性状指标显著关联(P<0.05),即C1272225T、G1272611A、C1271211T、C1270902T、A1270769G、G1270640C、T1270578C、G1270503C、T1270451C、C1270032T,其中A1270769G与7个周龄冠高指标均显著关联;G1272611A与5个周龄冠高指标显著关联;有10个SNP与冠长性状显著关联(P<0.05),即C1272225T、G1272611A、C1271211T、C1270902T、A1270769G、G1270640C、T1270578C、G1270503C、T1270451C、C1270032T,其中C1271211T与6个周龄冠长指标显著关联,G1272611A与5个周龄冠长指标显著关联。G1272611A位点与5个连续周龄冠长或冠高性状指标均显著关联,该位点在该群体中对应GG和GA 2种基因型,GG基因型个体的5个连续周龄冠高或冠长均显著高于GA基因型个体。【结论】G1272611A位点可作为宁都黄鸡冠高和冠长性状选育重要候选分子标记。
马荆鄂曾成瑶周敏谭玉文朱学农饶友生许继国
关键词:宁都黄鸡生长激素基因
吉林马HMGA2、GH基因多态位点挖掘及其与部分生长性状关联分析
旨在探讨不同性别吉林马成年马体尺、体重之间的相关性以及HMGA2基因GH基因多态性及其对吉林马体尺性状的影响,以期能够筛选出可用于提高吉林马体尺性状的分子标记,为吉林马优良性状定向选育提供依据。本实验以研究95匹健康的...
李瑶瑶
关键词:GH基因单核苷酸多态性体尺性状
梭鲈GH基因序列特征及其在生长差异个体间的表达分析
2022年
本研究旨在克隆梭鲈(Sander lucioperca)生长激素(growth hormone,GH)基因,探究其序列特征及其表达量与梭鲈生长的相关性,以期为梭鲈生长的分子机理研究鉴定基础。研究采用RACE技术从梭鲈垂体中克隆了GH基因,其cDNA全长为926 bp,包含74 bp的5′非翻译区、237 bp的3′非翻译区和编码204个氨基酸的开放阅读框。氨基酸多重比对发现,梭鲈GH与黄金鲈(Perca flavescens)、河鲈(Perca fluviatilis)的氨基酸序列相似性分别为97.04%和94.05%,GH基因在鱼类和哺乳动物中都存在四个保守的半胱氨酸残基位点。应用实时荧光定量PCR技术分析了GH基因在梭鲈各组织和体重极端差异个体间的表达特征,结果显示,GH基因在梭鲈各组织中均有表达,垂体中相对表达量最高,脑次之,与其他组织相比差异极显著(P<0.01)。GH基因表达量与梭鲈体重呈正相关,4个组织中GH基因表达量均为体重极大组高于极小组,其中垂体和脑中差异极显著(P<0.01),肌肉中差异显著(P<0.05)。因此,GH基因可以作为梭鲈生长候选基因用于分子选择。本研究结果可为进一步解析GH基因调控梭鲈生长发育的分子机制研究提供参考。
周佳孙志鹏吕伟华曹顶臣鲁翠云刘天奇吉宇丹郑先虎
关键词:梭鲈GH基因
不同gH基因型别先天性人巨细胞病毒感染新生儿临床特征
2022年
目的探讨不同人巨细胞病毒(HCMV)包膜糖蛋白H(gH)基因型别先天性HCMV感染新生儿的临床特征。方法选取2018年2月—2021年2月武汉科技大学附属孝感医院确诊的110例先天性HCMV感染新生儿为研究对象,根据尿液HCMV gH分型结果分为gH1组68例和gH2组42例。收集两组患儿新生儿期临床资料包括临床表现、实验室检查、听力以及神经系统预后评估情况。结果110例先天性HCMV感染新生儿中,gH基因型分布以gH1型为主(61.82%,68/110),无混合型感染。gH1组出现血小板减少患儿的比例高于gH2组(P<0.05),两组出现宫内生长受限、脾肿大、肝肿大、瘀斑、脉络膜视网膜炎、颅内钙化和症状性感染患儿的比例均无统计学差异;gH1组血小板水平低于gH2组,总胆红素水平高于gH2组(P<0.05)。gH1组和gH2组出现听力损失患耳的比例无统计学差异,gH1组听力损失程度达中重度及以上的患耳比例高于gH2组(P<0.05)。gH1组Alarcon评分低于gH2组(P<0.05)。结论医院先天性HCMV感染新生儿中,gH1型为优势基因型;gH1基因型在新生儿期中重度以上程度听力损失患儿中比gH2型更常见,而gH2基因型HCMV感染患儿具有更高的神经系统损害风险。
郑雯黄杰杨树杰易海英甘斌王艳华
关键词:人巨细胞病毒神经系统发育新生儿
日粮蛋白水平对鹅生产性能及GH基因表达的影响被引量:1
2021年
在5~10周龄期间,豁眼鹅分别饲喂高(15.5%)、中(14.5%)、低(13.5%)3种蛋白水平的日粮,探讨不同蛋白水平日粮对鹅生长性能、屠宰性能、肌肉组织生长激素(GH)基因mRNA表达的影响。结果表明:除第8、10周龄高蛋白组母鹅的体重显著高于低蛋白组母鹅的体重(P<0.05)外,不同蛋白水平之间在同日龄、性别时无显著性差异。在第10周龄时,母鹅高蛋白组活重、屠宰重、半净膛重、全净膛重显著性高于低蛋白组母鹅活重(P<0.05),高、中蛋白胸肌重显著性高于低蛋白组(P<0.05),中蛋白组胸肌率显著性高于低蛋白组(P<0.05)。其他指标在同性别不同蛋白水平之间无显著差异。第8、10周龄的胸肌、腿肌中GH基因mRNA表达量分别在不同组之间无显著差异。第8、10周龄的胸肌GH基因mRNA表达量要显著性高于腿肌(P<0.05)。随着鹅周龄增加,GH基因在肌肉中表达量下降。由此可知,在5~10周龄期间,公鹅宜用蛋白水平为13.50%的日粮,母鹅宜用蛋白水平为14.50%的日粮,日粮蛋白水平不会显著性影响GH基因在肌肉组织中的表达。
董飚顾文婕王健李小芬李小芬
关键词:蛋白水平生长激素基因
GH基因的研究进展被引量:3
2020年
生长激素是垂体的分泌产物,能够影响动物机体生长发育的速度。垂体中生长激素(growth hormone,GH)基因的表达量关系到生长激素的水平。文章主要简述GH基因在结构、组织中的表达以及影响其表达差异因素的研究进展。
丁晓晨王浩张丽余锦程吴尚耕刘月帅曹忻
关键词:生长激素GH基因影响因素
MyoG、IGF1和GH基因的SNP筛选及与家兔生长性状的关联分析
我国养兔历史悠久,是兔肉生产和消费的大国。传统的选育方法往往不利于家兔生长性状的早期育种选择,利用DNA水平的选择方式来实现代替遗传表型学作为科学基础的辅助选择,能大大提高选种的效率和准确性。本研究为了寻找与家兔生长性状...
周露
关键词:家兔MYOG基因IGF-1基因GH基因
文献传递
太湖鲂鲌F2代GH基因结构、系统发育和表达特征被引量:4
2020年
采用PCR及T-A克隆技术,从基因组DNA成功克隆三角鲂、太湖鲂鲌、太湖鲂鲌F2代含完整阅读框的生长激素基因全序列,经测序拼接获得序列全长分别为6009、6042和6058bp,转录单元长分别为2049、2014和2045bp。三种群体的GH基因序列均包括五个外显子、四个内含子及5′侧翼区和3′侧翼区;编码氨基酸序列均为633bp,编码210个氨基酸。对3个目14种鱼类进行同源性及系统发育分析发现,太湖鲂鲌F2代与其祖父母的遗传距离相比亲本较近。另取10尾太湖鲂鲌F2代,对其进行GH基因编码区SNPs筛选,共得到7处SNPs,其中有3处位点的突变导致其氨基酸序列发生了明显的变化;对其蛋白质结构分析发现,突变后的氨基酸残基导致蛋白质二级结构发生改变。我们将该10尾个体按体重分为小个体组和大个体组,经组织表达分析发现,大个体组中的个体具有较高的转录水平,进一步分析发现其氨基酸残基有所不同。
刘加林贾永义刘士力郑建波迟美丽程顺李飞尹绍武顾志敏
关键词:属间杂交SNPS

相关作者

陈国宏
作品数:745被引量:3,509H指数:29
供职机构:扬州大学动物科学与技术学院
研究主题:微卫星 地方鸡种 单核苷酸多态性 多态性 屠宰性能
段修军
作品数:241被引量:722H指数:16
供职机构:江苏农牧科技职业学院
研究主题:番鸭 黑羽 屠宰性能 宠物 肉品质
董飚
作品数:160被引量:329H指数:10
供职机构:江苏农牧科技职业学院
研究主题:番鸭 屠宰性能 黑羽 单核苷酸多态性 肉品质
冀德君
作品数:127被引量:341H指数:9
供职机构:扬州大学动物科学与技术学院
研究主题:中国荷斯坦牛 体细胞评分 奶牛 遗传分化 MSTN基因
常春芳
作品数:25被引量:90H指数:7
供职机构:扬州大学动物科学与技术学院
研究主题:GH基因 MSTN基因 肌肉生长抑制素 MSTN 牛亚科