搜索到1619篇“ 遗传变异分析“的相关文章
2001—2022年鸽圆环病毒的遗传变异分析
2024年
鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)是近几年发现的一种能引起感染鸽免疫抑制的病毒,属于圆环病毒科圆环病毒属。为研究PiCV的流行特征和遗传进化规律,试验从GenBank中选取208株PiCV全基因组序列,利用生物信息学软件,通过构建PiCV全基因组系统发育树,进行核苷酸同源性比较、氨基酸序列比对分析、抗原表位分析和基因重组等方式对其进行遗传变异分析。结果表明:基于构建的系统发育树可将208株PiCV毒株分为A(54.81%,114/208)和B(45.19%,94/208)两个基因型,其中A基因型可进一步分为A-1、A-2、A-3、A-4、A-55个不同的亚群,B基因型可进一步分为B-1、B-2、B-3、B-44个不同的亚群。208株PiCV全基因组序列的相似性为83.8%~100%。PiCV Cap蛋白氨基酸序列上存在氨基酸的点突变、缺失和插入等情况。208株PiCV全基因组序列中存在大量重组事件(44个),涉及A基因型序列中所包含的遗传物质的直接交换及ORF C1基因小片段的转移。说明PiCV的变异具有多样性。
郎雯陈煜杰吴敏慧苏梦容阮莲吕其壮
关键词:遗传变异分析系统发育树氨基酸序列分析
一种用于遗传变异分析的基因变异打分排序方法
本发明公开了一种用于遗传变异分析的基因变异打分排序方法,本案步骤S2的设置,不仅仅考虑到基因测序数据还充分考虑临床表型数据,以便于更准确地评估患者的遗传病风险;步骤S3和S4的设置,将已规范化的变异位点进行第一次过滤,过...
田卫东黄劭蔡响
文冠果无性系花表型性状遗传变异分析
2024年
【目的】为文冠果Xanthoceras sorbifolia花种质资源的利用及新品种的定向选育提供参考。【方法】以引种至盐城林场的23个文冠果无性系W1~W23为研究对象,通过比较其变异系数分析16个花表型性状的变异程度,包括株高、地径、冠幅、顶序长、顶序雌花数量、顶序雄花数量、顶序花蕾数量、顶序总花数量、红花型花色L值、黄花型花色L值、红花型花色a值、黄花型花色a值、红花型花色b值、黄花型花色b值、红花型花色C值、黄花型花色C值、W5S响应值、W1W响应值、W2W响应值,并采用Pearson相关系数评价各性状之间的相关关系,运用主成分分析、系统聚类法对各无性系进行综合评价和分类。【结果】参试无性系的14个花表型性状存在不同程度的变异,变异系数为9.62%~210.04%。共有5对指标间的相关性达到显著水平(P<0.05),14对指标间的相关性达到极显著水平(P<0.01)。选取冠幅、顶序长、顶序总花数量、红花型花色L值、红花型花色C值、黄花型花色L值、黄花型花色C值、W1W响应值、W2W响应值共9个重要评价指标进行主成分分析和聚类分析。通过主成分分析将9个指标简化为4个综合指标,累计方差贡献率达77.335%。各无性系的综合得分为-0.79~1.43,排名前5位的为W15、W5、W6、W19和W18。根据聚类分析结果将23个无性系分为3类,第Ⅰ类为花香优质型(W15),第Ⅱ类为花量大、花色优质型(W5和W19),第Ⅲ类为普通型(其余无性系)。【结论】参试文冠果无性系的花表型性状在各无性系间存在丰富变异,筛选潜力大。筛选出的优良无性系为W5、W15、W19,可进行推广栽培。
戚亚王改萍郑保砼彭大庆李硕民曹福亮
关键词:表型性状综合评价
广西壮族自治区1株类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)GP5基因的遗传变异分析
2024年
[目的]了解广西壮族自治区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的分子流行病学特征并揭示其遗传变异情况。[方法]利用PRRSV实时荧光RT-PCR试剂盒(通用型)对采集自广西壮族自治区某猪场临床发病猪只的肺脏组织样本进行PRRSV检测;利用PRRSV美洲型经典株与类NADC30 PRRSV毒株双重实时荧光RT-PCR试剂盒对样本进行进一步鉴定;采用PCR法扩增GP5基因,将测序获得的核苷酸序列与GenBank数据库中下载的国内外PRRSV参考株GP5基因核苷酸序列进行同源性比对,并构建系统遗传进化树;对GP5基因推导的氨基酸序列进行比对分析。[结果]经鉴定,该份样本呈类NADC30 PRRSV阳性,命名为GXYL株;GP5基因核苷酸序列同源性分析显示,GXYL株与国内外PRRSV参考株同源性为61.9%~93.2%,与美国NADC30毒株的同源性最高,与欧洲型LV毒株的同源性最低;遗传进化树分析显示,GXYL株与美国NADC30毒株以及中国类NADC30毒株位于同一分支,亲缘关系较近,与其他美洲型毒株同处一个大的分支;GP5基因推导的氨基酸比对分析显示,GXYL株共有7个位点发生变异,其中,2个突变位点位于A表位处,1个突变位点位于B表位处,4个突变位点位于信号肽区域,未发现有氨基酸的插入及缺失。[结论]GXYL株为类NADC30 PRRSV毒株,提示该地区应加强对PRRSV流行及变异情况的监控。
周明旭黄张玲黄胜斌周庆安胡丽萍莫胜兰韩银华蓝惠华颜健华韦海娜熊毅何奇松
关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5基因遗传变异分析
枣多倍体杂交子代生物学性状遗传变异分析
枣是原产我国的特色果树,是新疆林果的优势和主导产业。多倍体具有果实巨大性、生长旺盛、适应性强等特点,通过多倍体杂交创制的三倍体后代兼具杂种优势效应和基因的剂量效应,是多倍体育种关注的热点。目前通过有性多倍体杂交创制枣多倍...
葛立鑫
关键词:多倍体杂交子代生物学性状
常山柚橙不同树龄和繁殖方式的遗传变异分析
2024年
本研究以20~100年实生和嫁接的常山柚橙(Citrus×aurantium L.‘Changshanhuyou’)为材料,进行全基因组背景分析、体细胞变异检测和果实品质评价。结果显示,常山柚橙与药用枳壳基原品种黄皮酸橙(C.aurantium L.‘Huangpi’)、代代花(C.aurantium L.‘Daidai’)、朱栾(C.aurantium L.‘Chuluan’)和塘橙(C.aurantium L.‘Tangcheng’)聚类在一起,两者与酸橙(C.aurantium L.)的遗传相似度在76.99%~91.06%。随着常山柚橙树龄的增加,其果实品质发生变化,且体细胞变异总数增加。枳(Poncirus trifoliata(L.)Raf.)砧不会改变常山柚橙的果实品质,但其接穗中体细胞变异总数增加,其中变异基因涉及衰老修复和逆境防御过程。综上所述,常山柚橙是酸橙变种,且在常规生产年限内,其果实品质稳定,遗传物质保持不变,但体细胞变异数量逐渐积累。
张艺宋立志刘胜军阮林王霞宋剑锋汪丽霞徐强
关键词:嫁接体细胞变异
2018—2020年福建地区猪瘟病毒E0基因遗传变异分析
2024年
为了了解2018—2020年福建地区猪瘟病毒流行及遗传变异情况,收集福建省不同地区临床发病猪的血液和肺脏、脾脏、淋巴结等组织样本1464份,采用RT-nPCR的方法对样品进行CSFV检测,对部分CSFV阳性样品E0基因进行克隆测序。结果显示,CSFV总体阳性率为1.9%(29/1464),并获得13株CSFV E0基因序列。同源性分析发现所得13株CSFV E0基因之间的同源性在82.2%-99.7%,其中11株CSFV E0基因与1.1亚型代表毒株HCLV的核苷酸同源性为99.0%~99.9%,与Shimen株的核苷酸同源性94.1%~95.0%;1株与2.1c型参考毒株HNSD-2012核苷酸同源性为98.2%;1株与2.1d亚型毒株CSFV/JPN/2018核苷酸同源性为99.6%。遗传进化分析发现,10株CSFV与HCLV、C-ZJ-2008、Shimen和Brescia处于同一分支,属于1.1亚型;1株CSFV与HNSD-2012等位于同一分支,属于2.1c亚亚型;1株与CSFV/JPN/2018等位于同一分支,属于2.1d亚亚型。氨基酸序列分析发现,13株毒株与HCLV等代表毒株在重要的Rnase活性位点高度保守,其中2株2.1亚型毒株与HCLV毒株相比,其在第35位非关键氨基酸残基上发生由G→E的突变。结果表明福建地区CSFV流行情况趋向多样化,提示仍需加强对CSFV流行及遗传变异的持续监测,为猪瘟的诊断及有效防控奠定基础。
戴爱玲张鑫杰林楚云尹会方尹会方刘建奎杨小燕
关键词:猪瘟病毒E0基因
杏光合性状的遗传变异分析及主效基因挖掘
2024年
【目的】光合作用是果树产量和品质形成的关键生理过程,在果树遗传改良中具有重要意义,通过分析杏光合性状的遗传变异规律,为科学选配亲本及高光效杂交后代的筛选提供理论依据。【方法】以串枝红(高光合速率)为母本和骆驼黄(低光合速率)为父本进行杂交构建F1群体,采用Li-6400XT测定亲本及杂交后代的光合速率、气孔导度、胞间CO_(2)浓度与蒸腾速率。【结果】光合速率和气孔导度在F1群体中存在极端超亲单株。光合特性相关性状呈正态分布规律,具有典型的数量遗传特征。光合速率、蒸腾速率和胞间CO_(2)浓度主要受遗传效应影响。构建了包含1356个indel标记的杏高密度遗传图谱,标记平均间距为0.44 cM,利用该图谱共检测到7个与光合性状相关的QTLs,其中,光合速率、蒸腾速率和胞间CO_(2)浓度均定位在1号染色体的25.4~26.2cM附近,并结合富集分析结果发现PA01G03444可能是调控光合作用的1个主效基因。【结论】获得了7个与光合作用相关的QTLs,发现一个调控光合作用的主效基因PA01G03444,这为进一步探索杏树光合作用的分子机制提供了基因资源。
姜凤超杨丽张俊环张美玲于文剑孙浩元
关键词:光合性状QTL定位
‘长富2’ב金红’F1代苹果农艺性状的遗传变异分析
2024年
以‘长富2’ב金红’及其F1代为试材,对花期、叶片和果实性状进行遗传变异分析。结果表明,初花期以4月25日最多,开花持续天数以七八天居多。所有叶片性状、单粒重、果实横径、果实纵径、果型指数符合数量性状的遗传特点。叶片性状低于低亲率40.18%~83.04%,表现出明显的偏低遗传趋势;单果重、纵径和横径的平均值均小于亲本亲中值,且杂种优势率均为负值,表现出偏小的遗传倾向;酸低于低亲率48.21%,也表现出偏小的遗传倾向;果肉硬度表现出趋中的遗传趋势;可溶性固形物含量超高亲率为70.54%,表现出明显的超高亲遗传倾向。总之,杂交后代农艺性状呈现较广分离,有趋向于高糖和低酸的遗传趋势,同时叶片性状、单果重有趋向于低亲的遗传趋势。
黄金凤吕天星闫忠业王冬梅刘志田帅
关键词:性状
“长富2号”ד金红”苹果F1代糖酸性状的遗传变异分析
2024年
以苹果品种“长富2号”ד金红”及其杂交后代的实生群体为试材材料,利用高效液相色谱法测定果实糖酸组分含量。结果表明:杂交后代果实中以积累果糖和苹果酸为主,含量范围分别为29.11~65.71 mg/g和2.79~8.24 mg/g。各糖酸组分含量均呈正态分布(除柠檬酸),是多基因控制的数量性状,而柠檬酸含量呈偏正态分布,其遗传可能存在主效基因。果糖、葡萄糖和奎尼酸的遗传是基因加性效应和非加性效应共同作用的结果,而蔗糖和苹果酸含量主要受基因的加性效应影响。各糖酸组分含量在杂交后代中出现广泛的分离,变异系数均超过21%。本群体倾向于高果糖及低苹果酸亲本遗传,具有筛选风味优良单株的潜力。
黄金凤黄金凤闫忠业吕天星闫忠业王冬梅杨锋
关键词:苹果F1代糖组分

相关作者

刘长明
作品数:266被引量:675H指数:15
供职机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
研究主题:猪圆环病毒2型 PCV2 猪圆环病毒 单克隆抗体 CAP蛋白
危艳武
作品数:210被引量:386H指数:12
供职机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
研究主题:猪圆环病毒2型 PCV2 CAP蛋白 猪繁殖与呼吸综合征病毒 毒株
黄立平
作品数:158被引量:226H指数:10
供职机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
研究主题:猪圆环病毒2型 PCV2 CAP蛋白 单克隆抗体 遗传变异分析
李彬
作品数:330被引量:646H指数:12
供职机构:江苏省农业科学院
研究主题:猪流行性腹泻病毒 引物 冠状病毒 猪流行性腹泻 猪繁殖与呼吸综合征病毒
王隆柏
作品数:268被引量:632H指数:12
供职机构:福建省农业科学院
研究主题:猪流行性腹泻病毒 副猪嗜血杆菌 猪繁殖与呼吸综合征病毒 猪圆环病毒 猪瘟