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肿瘤相关基因改变与三级淋巴结构形成的关系及对肿瘤预后影响的研究进展: 2024年; 近年来多项研究表明三级淋巴结构(tertiary lymphoid structures,TLS)与大多恶性肿瘤良好预后及免疫治疗疗效相关,对临床的治疗决策选择具有重要作用,但肿瘤相关基因改变和TLS之间的关系还很少被研究,基因改变在TLS诱导调控中的具体作用如何?本文将对肿瘤TLS的组成和结构、形成机制、肿瘤相关基因改变与TLS关系、对肿瘤预后影响、以及未来展望等方面进行综述,更详细地了解TLS的功能及其基因改变在其中的潜在作用,以期为临床精准治疗及新药物的开发提供相关依据。; 车雨柔杨曼李柯臻董娟李思敏张艺耀徐祝王梅罗丽萍方曾怡吴川王卫东; 关键词：恶性肿瘤基因肿瘤微环境

基于GEO数据库探究结直肠肿瘤相关基因及其功能: 2024年; 目的利用生物信息学分析方法,结合GEO数据库,探讨获取结直肠肿瘤关键基因的差异表达情况。方法使用GEO数据库分析结直肠肿瘤患者的肿瘤组织和正常组织基因表达数据,使用GEO2R筛选差异表达基因(differential expression genes,DEGs),利用David数据库对DEG进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析,获得DEG的分子功能、细胞组分和生物过程结果,利用基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)获取差异基因在疾病状态下的信号通路信息,构建差异基因间蛋白质相互作用网络,并使用Cytoscape软件对网络中的关键节点进行拓扑分析,筛选出结直肠肿瘤患者发生过程中的关键基因。结果通过对GSE21510数据集的生物信息学分析,共鉴定到664个DEGs,其中结直肠肿瘤患者高表达基因234个,低表达基因430个。这些DEGs主要参与细胞分裂、RNA聚合酶II启动子转录正和负调控等生物过程,同时参与细胞核、胞质、细胞质、核浆、细胞膜等细胞成分组成,并参与蛋白质绑定、ATP绑定等分子功能的表达和实现等过程,通过蛋白质网络分析确定高表达基因CDK1、CCNB1、TOP2A、AURKA、UBE2C、BUB1、CHEK1、RRM2、MYC、TPX2和低表达基因SLC26A3、CLCA4、GUCA2A、MS4A12、ZG16、GUCA2B、CLCA1、AQP8、MT1E、MT1G为关键基因。生存分析结果显示,关键基因CCNB1低表达与CRC患者预后较差显著相关(logrank P<0.01);此外,CCNB1基因与肿瘤病理分期显著相关(P<0.01)。结论所筛选的关键基因可能成为诊断或治疗结直肠肿瘤的的标志物或潜在靶点,本研究结果为结直肠肿瘤的发病机制、治疗方法等领域的研究提供了理论参考。; 景凯景凯李乐平; 关键词：结直肠肿瘤生物信息学分析差异表达基因

gga-miR-130b-3p对鸡MDCC-MSB1细胞中肿瘤相关基因表达的影响: 2024年; 为鉴定MD淋巴瘤转化细胞中gga-miR-130b-3p调控的肿瘤相关基因,本研究在MDV转化的鸡淋巴细胞系MDCC-MSB1中过表达该miRNA,转染48 h后收集并提取RNA,利用高通量测序获得过表达gga-miR-130b-3p组和阴性对照组(Negative control,NC)的转录组数据,筛选这些数据中的差异表达基因(Differential expressed genes,DEGs),对DEGs进行基因本体GO功能富集分析、信号通路分析以及基因集富集分析,筛选过表达ggamiR-130b-3p前后基因表达变化可能参与的信号通路,并对两组中的差异可变剪切进行分析。结果表明:1)与NC组相比,过表达gga-miR-130b-3p组中共鉴定出117个DEGs,其中83个DEGs显著上调,34个DEGs显著下调。其中MCM10、KCNA3、PTK2、FGL2、GPAM、BMP4、LOXL3、DDO和KRAS等基因可能影响MD肿瘤转化。2)DEGs注释到46个GO条目中,其中生物过程包含免疫系统过程等在内的22个条目,分子功能包括10个条目,细胞组分包括14个条目。3)mimics NC和mimics转染组中的DEGs以及微效基因富集到7个与肿瘤发生相关的通路,其中主要是通过甲状腺激素信号途径、胆碱代谢等通路发挥抑癌作用。4)过表达gga-miR-130b-3p后差异可变剪切类型最多的是外显子跳跃(Exon skipped,ES),其次是内含子滞留(Intron retained,IR),最少的是外显子互斥(Mutually exclusive exon,MXE)。综上,gga-miR-130b-3p高表达会引起MSB1细胞中的部分基因差异表达,这些DEGs通过抑癌信号通路抑制MD的肿瘤发展进程,该研究可为解析miRNA在MD肿瘤转化过程中的作用机制提供理论依据。; 李家乐金涛朱国志陈沈峻杨林刘心雨李升和赵春芳; 关键词：转录组测序

一种肺部肿瘤相关基因变异检测用的多重PCR引物组及其用途: 本发明涉及分子诊断领域，特别是涉及一种肺部肿瘤相关基因变异检测用的多重PCR引物组及其用途。本发明提供的引物组为检测如下基因的引物组：ALK基因、BRAF基因、EGFR基因、ERBB2基因、KRAS基因、MET基因、NR...; 杨成镐孙建龙张通陈光辉丁波

一种肺部肿瘤相关基因变异检测用的多重PCR引物组及其用途: 本发明涉及分子诊断领域，特别是涉及一种肺部肿瘤相关基因变异检测用的多重PCR引物组及其用途。本发明提供的引物组为检测如下基因的引物组：ALK基因、BRAF基因、EGFR基因、ERBB2基因、KRAS基因、MET基因、NR...; 杨成镐孙建龙张通陈光辉丁波

骨髓增生异常性肿瘤相关基因突变及治疗展望: 2024年; 骨髓增生异常性肿瘤(Myelodysplastic neoplasms,MDS)是一种血液系统克隆性增殖性疾病。采用二代基因测序(Next-generation sequencing,NGS)等方法,研究者发现超过80%的MDS患者在涉及不同细胞途径的基因中至少有一个或多个突变^([1])。许多突变基因,如TET2、ASXL1、SF3B1、SRSF2、DNMT3A和RUNX1等的突变发生率均在10%以上。这些突变基因与MDS的启动、发展、危险分层、诊断、治疗反应及预后判断密切相关。现就MDS的基因突变、发病机制及针对突变基因的后续应对研究等作一综述,以期对MDS分子遗传学异常、发病机制及相应的药物研发有进一步了解。; 伍学强惠卉; 关键词：基因突变

一种肿瘤相关基因IKBKB突变短肽及其在肿瘤疫苗中的应用: 本发明提供的一种肿瘤相关基因IKBKB突变短肽及其在肿瘤疫苗中的应用，所述IKBKB突变短肽的氨基酸序列如SEQ ID NO：2‑SEQ ID NO：10中的任一条所示；所述IKBKB突变短肽在诱导制备特异性细胞毒性T细...; 张腾飞李欣阳李砺峰严家芹王愈翔程湘

一种肿瘤相关基因BCL6突变短肽及其在肿瘤疫苗中的应用: 本发明提供的一种肿瘤相关基因BCL6突变短肽及其在肿瘤疫苗中的应用，所述BCL6突变短肽的氨基酸序列为HPAGPTFPE，如SEQ ID NO：2所示；所述BCL6突变短肽在诱导制备特异性细胞毒性T细胞克隆、制备人体免疫...; 张腾飞李欣阳

基于生物信息学方法的垂体GH细胞肿瘤相关基因的研究: 目的:通过检索公共数据库运用生物信息学方法分析研究基因表达芯片,拟获得垂体GH细胞肿瘤和裸细胞肿瘤之间的基因差异表达情况。根据生信分析结果,选定差异表达明显、具有显著生物学意义的目标基因进行研究,并在组织学水平进行Wes...; 王晨龙; 关键词：生物信息学分析

结直肠肿瘤相关基因与靶向药物的研究进展被引量：1: 2023年; 结直肠肿瘤是临床最常见的恶性肿瘤之一,其主要特点为进展快、预后差。目前现代医学对结直肠肿瘤治疗主要以手术联合放化疗为主。本文结合结直肠肿瘤的基本情况、原癌基因、抑癌基因、靶向药物及常用靶向治疗联合用药,对结直肠肿瘤相关研究进行综述,旨在为结直肠肿瘤的基因学研究与药物研发提供思路与借鉴。; 石炳林赵士博; 关键词：结直肠肿瘤基因研究靶向药物联合用药

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