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一种实时荧光PCR数据管理系统
本发明公开了一种实时荧光PCR数据管理系统,包括:数据采集模块,用于自动读取各个监测设备上的荧光PCR数据;数据解析模块,用于对读取到的荧光PCR数据进行解析,获得解析数据;辅助研判模块,用于基于机器学习模型,对所述解析...
周信夏俊鹏周乐
杜鹃芽枯病菌PCR实时荧光PCR检测
2024年
根据GenBank中杜鹃芽枯病菌(Seifertia azaleae)及其相关种ITS序列设计特异引物SA1/SA2和探针SA-P,建立杜鹃芽枯病菌常规PCR实时荧光PCR检测方法。引物SA1/SA2能扩增5株S. azaleae菌株DNA,得到351 bp的预期扩增产物,其他供试菌株均不能扩增出预期产物,检测灵敏度达60 pg菌体DNA。探针SA-P对5株S. azaleae均表现为阳性扩增,其他供试菌株均为阴性扩增,检测灵敏度可达60 fg菌体DNA,比常规PCR高1000倍。对杜鹃花苞样品和叶片样品的检测结果表明常规PCR实时荧光PCR检测方法均可用于进境杜鹃种苗中杜鹃芽枯病菌的快速检测。
龚静如段维军龚婕王寅鹏崔金璐易建平
关键词:常规PCR实时荧光PCR
荞麦源性成分实时荧光PCR检测方法的建立
2024年
为检测荞麦类食品及原料中的荞麦源性成分,根据荞麦品种DW-1核酸序列信息(KY945277.1)设计了荞麦品种特异性引物;以苦荞和甜荞品种基因组为模板,建立了荞麦源性成分的实时荧光PCR(qPCR)的检测方法,并对购自市场的多个粮食产品进行检测,检测结果与商品标识相符方法特异性强、灵敏度高,为食品中荞麦源性成分的检测提供了新思路。
王哲贤张颖亢春雨亢春雨檀建新赵世峰
关键词:荞麦实时荧光PCR
实时荧光PCR检测鼠源性成分的定性方法验证
2024年
本文探讨了GB/T 38164—2019《常见畜禽动物源性成分检测方法实时荧光PCR法》在肉类食品源性成分检测中鼠源性成分检测的可行性和适用性,旨在为动物源性成分的方法验证工作提供参考。结果表明,GB/T 38164—2019的实验方法对大鼠具有较好的特异性,能够准确检测肉类食品中的大鼠鼠源性成分。然而,该标准方法在检测肉类食品中的鼠源性成分时,不具有适用性,需要进一步优化。
张从党王均华王亚平张维益包静云
关键词:实时荧光PCR
玉米细菌性枯萎病菌实时荧光PCR检测方法的建立
2024年
玉米细菌性枯萎病菌(Pantoea stewartii subsp. stewartii,Pss)是我国进境植物检疫性有害生物。根据Pss与其近似种序列差异,设计特异性引物PS3F/PS3R和探针PS-3P,建立Pss实时荧光PCR检测方法。测试结果显示,供试的6株Pss菌株均有阳性扩增,其他74株供试菌株和空白对照均为阴性扩增,菌体DNA的检测低限为13 fg;对模拟带菌玉米种子进行实时荧光PCR检测并建立标准曲线,R2=0.998 8,线性关系良好。本文建立的实时荧光PCR检测方法可为口岸检疫提供一种准确快速检测方法。
丁钿牟桂萍魏霜李献锋林晓红章柱易建平
关键词:玉米细菌性枯萎病菌实时荧光PCR
鸽腺病毒通用型实时荧光PCR检测方法的建立与应用
2024年
鸽腺病毒(pigeon adenovirus,PiAdV)是影响鸽产业健康发展的重要病原之一。为实现PiAdV的高通量快速检测,根据GeneBank登录的PiAdV-A种和PiAdV-B种病毒pⅧ基因序列的共同保守区域设计特异性检测引物和探针,经反应条件优化,建立了一种PiAdV通用型实时荧光PCR检测方法,并对该方法进行了特异性、敏感性、重复性试验。结果显示:该方法的最佳探针浓度为0.2μmol/L,与鸽群其他常见病毒无交叉反应,对PiAdV的最低检测限为56.9 copies/μL,比常规PCR敏感性高100倍,组内和组间重复变异系数均小于1.8%。利用该方法和常规PCR方法对20份疑似PiAdV感染样品进行检测,发现PiAdV通用型实时荧光PCR检测方法的病毒阳性检出率高于常规PCR方法。结果表明,本研究建立的PiAdV通用型实时荧光PCR检测方法特异性强、敏感性高、可靠性好,可用于PiAdV感染的临床检测及流行病学调查。
陈璐朱明慧丁雨李阳亓丽红房立春蒋文明王静静王静静李建亮刘华雷
关键词:通用型实时荧光PCR
贵州蓝莓蜜TaqMan探针实时荧光PCR检测方法的建立与应用
2024年
该研究利用TaqMan特异性探针实时荧光PCR检测手段,建立了高效、精准鉴别贵州特色(中蜂)蓝莓蜜的方法。对贵州白竹林、麻卡和乌卡坪三个地域的蓝莓种植区蓝莓蜜进行采集(包括意蜂蓝莓蜜),同时购买市售蜂蜜及加拿大蓝莓蜜,该方法通过采集贵州麻江县白竹林地区蓝莓种植园及蜂场周围蓝莓同花期26种植物样本,基于植物基因组中trnL基因序列的多序列比对,设计蓝莓trnL基因特异性引物,并进行TaqMan探针验证。结果表明,本研究设计的TaqMan探针特异性强,建立的TaqMan探针实时荧光PCR检测方法能检测到蓝莓花粉DNA最低浓度为0.3 ng/μL;利用建立的方法对11种市售蜂蜜和贵州蓝莓蜜样本进行检测,发现贵州蓝莓蜜的Ct值为24~26,蓝莓花粉数在800~1700颗,其余蜂蜜Ct值在30以上,表明该方法能够有效实现贵州蓝莓蜜和其他蜂蜜的区分,具有良好的应用前景。
张致豪孙丽萍师丰丰黄家兴韦小平
关键词:实时荧光PCRTAQMAN探针蜜源植物
食品中唐菖蒲伯克霍尔德氏菌实时荧光PCR检测的研究
2024年
目的:建立唐菖蒲伯克霍尔德氏菌的核酸检测方法。方法:根据16S~23S rRNA基因片段序列,利用Oligo7设计TaqMan探针及引物,并验证实时荧光PCR检测方法的特异性和灵敏性。结果:用实时荧光PCR检测方法检测15株标准菌株,只有唐菖蒲伯克霍尔德氏菌呈阳性,验证了此方法具有良好的特异性。灵敏度实验中得出菌液灵敏度为5.8×10~2 CFU·mL^(-1),DNA灵敏度为7.2×10^(-4) ng·μL^(-1)。结论:建立的实时荧光PCR检测方法有良好的特异性和灵敏度,该方法可用于唐菖蒲伯克霍尔德氏菌的快速检测,具有较好的应用价值。
蔡彦秋查杰沐阳陈辉
关键词:实时荧光PCR特异性灵敏性
一种用于鉴定白犀成分的引物探针组及实时荧光PCR检测方法
本发明公开了一种用于鉴定白犀成分的引物探针组及实时荧光PCR检测方法,本发明根据白犀Cytb基因设计引物及探针,上游引物F为5’—TCAGGAATCCCATCCAACATAGA—3’,下游引物R为5’—GGGCGAGTA...
王春阳白素英马跃王震金煜张伟
一种用于靶基因实时荧光PCR检测的探针组合、引物组、试剂盒及其应用
本发明公开了一种用于靶基因实时荧光PCR检测的探针组合,包括一个或多个靶基因特异性寡核苷酸报告探针和一个或多个通用寡核苷酸淬灭探针;本发明还公开了用于靶基因实时荧光PCR检测的引物组、用于多重核酸实时荧光PCR检测的试剂...
张祥林张劲松魏鹏全淼王中侯艳雯胡秋萍黄华生

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朱水芳
作品数:321被引量:1,357H指数:22
供职机构:中国检验检疫科学研究院
研究主题:实时荧光PCR 引物 试剂盒 植原体 病毒
高宏伟
作品数:111被引量:176H指数:8
供职机构:山东出入境检验检疫局
研究主题:引物 实时荧光PCR 快速检测试剂盒 显色剂 探针
陈颖
作品数:505被引量:2,154H指数:23
供职机构:中国检验检疫科学研究院
研究主题:试剂盒 引物 食品 实时荧光PCR 探针
孙敏
作品数:92被引量:157H指数:7
供职机构:南京农业大学动物医学院
研究主题:引物 实时荧光PCR 快速检测试剂盒 保守序列 探针
刘彩霞
作品数:44被引量:44H指数:4
供职机构:山东出入境检验检疫局
研究主题:实时荧光PCR 引物 快速检测试剂盒 保守序列 加工品